Часовой пояс: UTC + 3 часа




Куратор(ы):   Biker    MegaCalcii   



Начать новую тему Новая тема / Эта тема закрыта, вы не можете редактировать и оставлять сообщения в ней. Закрыто  Сообщений: 260 • Страница 12 из 13<  1 ... 9  10  11  12  13  >
  Пред. тема | След. тема 
Автор Сообщение
 
Прилепленное (важное) сообщение

TSC! Russia ex-Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.12.2002
Откуда: TSC! | Москва
Тема предназначена для публикации новостей о проекте Folding@Home.

Комментарии к новостям - только в порядке дополнения или исправления ошибок. Все другие обсуждения - в соответствующих темах форума.

Наиболее значимые новости и события:
2017г.
Новый адрес сайта новостей http://folding.stanford.edu/news/
2016г.
Проблемы на 21 ядре (OpenMM GPU) с новыми драйверами NVIDIA 375.57 и 375.63 в Windows
2015г.
Достижения FAH в 2015 со взглядом на 2016 год
07.07.2015 Первая полная версия Folding@Home клиента для Android-устройств
24.02.2015 Появление ядра 18 новой 0.0.4 версии теперь и под Linux и для карт AMD
Поддержка Больших Жаб(bigadv) прекращена с 31.01.2015г.
2014 г.
Новый способ расчетов - Folding в браузере
9.07.2014 Появление нового ядра 18 версии под Windows/Nvidia и заданий под него, которое является улучшенной версией 17 ядра
2013 г.
Проект F@H преодолел 10 петафлоп
Новое универсальное AMD/nVidia GPU ядро (FahCore_17) в открытом тестировании!
2007 г.
Сеть Folding@home занесена в Книгу рекордов Гиннеса


Последний раз редактировалось MegaCalcii 14.10.2017 10:50, всего редактировалось 114 раз(а).
Моделируемая динамика гликанов на лигандсвязывающей области NMDA рецепторов показывает сильное динамическое сцепление между ядром белка и гликанами



Партнер
 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 24.10.2002
Откуда: Петербург
Новый способ расчетов - Folding в браузере
Vijay Pande, 24.02.2014 писал(а):
Совместно с Google, лабораторией Huang в Университете Науки и Техники Гонконга и лабораторией Pande в Универстите Стэнфорда мы работаем над новым способом работы Folding@home - в браузере. Основная идея - сделать фолдинг максимально простым для запуска обычным пользователем.

Open beta
Мы рады сообщить, что начинаем первое открытое бета тестирование веб клиента. Он использует Google Native Client¹ - технологию, благодаря которой стало возможным запустить Folding@home в браузере.

Скачать и установить приложение можно из Магазина Chrome.
Заметим, что приложение работает только в Google Chrome версии 31 и выше.
Для поддержки пользователей мы открыли новый раздел в нашем форуме.

Требования
Для работы веб клиента F@H необходимо удовлетворить три основных требования:
1) использовать Chrome Browser в Windows, Linux, или MacOS-X
2) установить Folding приложение из Chrome Web Store
3) запустить Folding приложение. И всё!

Дополнительные опции:
1) Вы можете настроить в Folding App имя пользователя, номер команды и пасскей.
2) Если вы не хотите устанавливать Folding App, вы всегда можете использовать прямую ссылку в любом Хроме на Windows, Linux или OSX

Open source
Это первый F@H клиент с полностью открытым исходным кодом. Веб клиент использует новый Assignment Server и новую версию Work Server, которая предоставляет JSON интерфейс для сторонних разработчиков. Вычисления выполняются на основанном на Gromacs 4.6.5 ядре с закрытым в целях безопасности кодом.
Разработчики приглашаются на github, пользователи могут отслеживать открытые вопросы. Для разработчиков доступен лог файл создаваемый из NaCl (Developer Tools > Console)

Следующие шаги
Как многие уже, наверное, заметили это открывает двери для движения Folding@home от браузера на компьютере к браузеру на телефоне или планшете. И мы активно изучаем эти возможности.

Несколько дополнительных ссылок:
Folding App Source Code: https://github.com/FoldingAtHome/fah-nacl-client
Folding App FAQs: https://folding.stanford.edu/home/faq/faq-foldinghome-app/
Third Party Forum: https://foldingforum.org/viewforum.php?f=32
Folding@Home Homepage: http://folding.stanford.edu/home/
Chrome DevTools: https://developers.google.com/chrome-developer-tools/


¹ Native Client - это песочница для эффективного и безопасного выполнения скомпилированного C и C++ кода в браузере независимо от операционной системы.

Добавлено спустя 54 минуты 46 секунд:
Создана тема для обсуждение веб клиента


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 24.10.2002
Откуда: Петербург
Проект Folding@home награжден Compute The Cure Award
Vijay Pande, 24.11.2014 писал(а):
Я счастлив сообщить, что Folding@home был награжден Compute The Cure Award от NVIDIA. Их финансовая поддержка поможет в создании новой инфраструктуры Folding@home и поддержит наши научные исследования. Больше информации смотрите в их объявлении.


PS
Compute The Cure Award ($400K) получили две команды: проект Folding@home и команда Джона Куэкенбуша, профессора биостатистики и вычислительной биологии в Бостонском Институте Рака Дана-Фарбер


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Поддержка Больших Жаб(bigadv) прекращена с 31.01.2015г.
Vijay Pande, 31.01.2015 писал(а):
Как мы анонсировали ранее, программа bigadv(BA) достигнет конца жизненного цикла 31 января 2015г. Мы хотели бы поблагодарить всех участников программы. На протяжении истории Folding@Home их участие помогло нам решать сложные проблемы и участвовать в смелых экспериментах. Проект BA это один из тех, который не мог быть решен иначе. Мы до сих пор анализируем результаты этих проектов, но предварительные данные уже дают некоторые интересные результаты, которые мы сравниваем с экспериментами.

Хотя программа BA заканчивается, мы признаем, что многоядерные системы, ранее использовавшиеся в BA, не могут оптимально выполнять работу в экосистеме Folding@Home(хотя делают это очень хорошо). В идеальном мире мы бы для каждого проекта использовали максимальную производительность на широком спектре систем и динамически распределенную схему, по которой клиенты использовались бы оптимально для проектов на их оборудовании, при этом обеспечивалось бы распределение возможностей клиента по научным приоритетам Folding@Home.
Однако, такое сопоставление требует бОльшего технического участия,(и требует больше места на Распределяющем Сервере) чем мы можем себе позволить в данное время.
После окончания BA, для многоядерных систем и дальше лучше всего использовать флаг bigadv, они будут перенаправлены на большие рабочие задания, хотя очки будут начислены по нормальной схеме Folding@Home, а не по схеме BA.
Мы планируем расширить разнообразие рабочих заданий, включив варианты "больших" моделирований, но на данный момент мы не делаем заявлений о продолжительности жизни этой схемы.

Спасибо еще раз за вклад в Folding@Home, в программу BA или в любую другую нашу инициативу. Все наши прошлые и будущие научные достижения, благодаря вашему участию и щедрости

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Краткий список последних новостей F@H, сугубо технических, т.к. новости медицинской и научной направленности переводить очень сложно для меня:
1) 24.02.2015 Вышла новая 0.0.4 версия 18 ядра на Windows для бета-тестеров, ловится на ключ beta

2) 25.02.2015 Теперь сервера раздают задания на 18 ядре версия 0.0.4 и для карт АМД, пока только с ключом beta

3) 25.02.2015 Вышла новая 0.0.4 версия 18 ядра на Linux для бета-тестеров, ловится на ключ beta

4) Со 2.03.2015 убран бонус для заданий на ядре А4, который составлял примерно -10%

5) 25.02.2015 Обновлен psummary(project summary, описание проекта) по основному адресу, из которого берет информацию, например, FahSpy и другие сторонние программы статистики

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Клиент Folding@Home для мобильных телефонов на Андроид
Mark Piercy, 19.03.2015 писал(а):
Мы рады сообщить, что клиент Folding@Home для мобильных телефонов на Андроид вошел в следующую стадию бета. Эта версия будет доступна для всех мобильных телефонов на Андроид версии 4.4(КитКат) и выше. Версия также содержит обновление библиотеки mmlib.

Также, как и в предыдущих бета запусках, в мобильном приложении мы продолжим фокусироваться на раке молочной железы. В этом проекте мы исследуем природу лекарств и их сопротивления мутациям в ключевых белках(киназы) которые являются мишенью для лекарства от рака молочной железы.
Изучая природу, как эти мутации изменяют ключевые цели лекарств, мы сможем заранее понять основные биофизические процессы этих ключевых белков, а также построить инструмент, который будет использоваться для лечения рака груди конкретного пациента - путем секвенирования(это общее название методов, которые позволяют установить последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК (прим. Calcii)) опухоли и видя что мутации присутствуют, наш инструмент рекомендует лучшее лекарство для конкретного пациента.

Мы планируем обновить пользовательский опыт в ближайшие месяцы, включая обновление в областях, предложенных участниками. Пока что мы были довольны реакцией участников. Бета-версия была скачана более 150 000 раз по всему миру c более чем 53 000 мобильных телефонов

Версия для всех остальных мобильных устройств, а не только для устройств Sony, как сейчас, появится в ближайшие месяцы, так что ждем дальнейших новостей
Версия новости на сайте команды TSCRussiateam.ru

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Использование "Модели Состояний Маркова" для изучения эффекта мутаций Триптофана
Vincent Voelz, 01.05.2015 писал(а):
В новой статье мы описываем наши усилия по использованию Модели Состояний Маркова(МСМ) в изучении мутации триптофана и как они влияют на сворачивание и конформационную динамику из серии модели пептидов "бета-шпильки".
Эта работа представляет собой самое обширное моделирование "β-шпильки" на сегодняшний день(9.4 мс в совокупности), это стало возможным, благодаря столь ценным усилиям участников Folding@Home! Траектории данных, полученных через Folding@Home сделали возможным конструирование МСМ с высоким разрешением, где мы использовали тот же набор метастабильных конформационных состояний для нескольких последовательностей.
Следовательно, мы могли бы спросить, как мутации триптофана возмущают переходы между отдельными состояниями, а также глобальную кинетику сворачивания и устойчивость.
Наше исследование предсказывает, что последовательности с триптофанами около окончаний шпильки(так называемые бета-кэп) сворачиваются более согласованно и более стабильны, чем последовательности “природного типа” и согласуются с экспериментальными исследованиями. Также, в соответствии с экспериментами, мы нашли что последовательность с четырьмя триптофанами (trpzip4) имеет более медленное кинетическое сворачивание, чем последовательности природного типа. Наши модели показывают, что это отчасти из-за множества не-родных "ловушек", которые замедляют сворачивание, состоя из многих перевернутых топологий шпильки. Существование этих ловушек может помочь объяснить, почему богатые триптофаном белки редки в природе, несмотря на способность триптофана стабилизировать сворачивание. Мы верим, что такие исследования основанные на МСМ это большой инструмент для изучения отношения последовательности структуры и функции, и мы ожидаем, что это будет иметь актуальность в дизайне белков

Обновление статистики браузерного клиента
Vijay Pande, 04.05.2015 писал(а):
Хорошие новости для участников браузерного клиента "NaCl": мы обнаружили проблему с одним из серверов в Гонг-Конге, который не начислял очки(в то время как сервера в Стэнфордском университете были в порядке) так что мы ожидаем, что участники браузерного клиента увидят еще немного больше очков в ближайшее время

Новые задания для Максвеллов
Vijay Pande, 05.05.2015 писал(а):
Не вешайте нос, участники с видеокартами: Мы изучили проблему нехватки заданий для видеокарт на основе Максвеллов. В дополнение к увеличению заданий, мы также работаем над улучшением инструментов мониторинга.
С таким множеством различных вариантов заданий, для конкретного под-подтипа(задания для видеокарт являются подтипом, а задания для Максвеллов под-подтипом) они легко могли закончится, т.к. пользуются большим спросом.

Два сервера с проблемами которых мы работаем
Vijay Pande, 07.05.2015 писал(а):
Мы работаем над проблемами двух серверов. Были некоторые проблемы с главным раздающим сервером(Assignment Server - AS) и с сервером обслуживающим SMP(Symmetric Multi-Processing симметричная многопроцессорная обработка) задания(171.64.65.124). Мы опубликуем обновления, как только сможем

Исправления для недавно отключенного сервера FAH
Vijay Pande, 07.05.2015 писал(а):
Сервер работает, мы будем совершенствовать систему оповещения об ошибках серверов, бла-бла-бла

Проблемы с 171.67.108.60 и 171.64.65.124
Vijay Pande, 09.05.2015 писал(а):
Мы видим проблемы с 171.67.108.60 и 171.64.65.124 и изучаем их

Проблема с fah-web.stanford.edu
Vijay Pande, 17.05.2015 писал(а):
Скорее всего из-за недавнего сильного(что бывает необычно редко) электрического шторма у нас были некоторые проблемы с сервером в последнюю неделю. Я думал мы разрешили их все, но как мы видим сейчас, есть проблема с fah-web.stanford.edu, который служит как сервер статистики и описания проектов Folding@Home. Хотя статистика накапливается на отдельном сервере, fah-web это веб сервер, который отображает статистику для участников. Я посмотрел пристальнее и оказалось это более серьезная проблема с определенным сервером, чем я себе представлял. Я сделал запрос команде системных администраторов. Надеюсь, что предполагаемое время починки будет в понедельник в полдень(предполагая, что это что-то простое).
Статистика продолжает учитываться и появится, как только будет решена проблема с веб сервером(fah-web), итак мы ожидаем что команда системных администраторов легко решит это, получив в понедельник.
ОБНОВЛЕНИЕ Понедельник 18 мая в 10 утра по тихоокеанскому времени: Мы вернули машину обратно и все выглядит хорошо. Похоже, проблема была в сервере, который находился под большой нагрузкой после шторма, что привело к сбросу PERQ(компьютерная рабочая станция)
под нагрузкой, давняя проблема, которая переводит файловую систему в только для чтения или в автономный режим, начало проблемы 16 мая 19:21:52.
Мы планируем покупку нового оборудования, тем более что это оборудование устарело

Задания для многоядерных CPU
Vijay Pande, 21.05.2015 писал(а):
Мы получаем сообщения, что FAH имеет низкую производительность на CPU заданиях. Мы находимся в процессе добавления большего количества заданий для многоядерных CPU.
Кроме того, главная задача текущего ведущего разработчика Joseph'а Coffland'а состоит в том, чтобы выпустить новое ядро Gromacs для CPU, чтобы позволить считать несколько новых научных проектов на CPU(которые в данный момент легко выполнимы для GPU).
Мы предполагаем первое тестирование этих новых ядер приблизительно в течении нескольких недель.

Представляем группу Shukla из Иллинойса
Diwakar Shukla, 26.05.2015 писал(а):
Группа Shukla (http://www.shuklagroup.org) в университете штата Иллинойс в Урбана-Шампейн только что настроила сервера Folding@Home(ds01[a-d].scs.illionis.edu), которые помогут нам выполнять захватывающие вычислительные эксперименты в сотрудничестве с энергичным F@H сообществом.

До прихода в Иллинойс в январе 2015, после защиты докторской я был в лаборатории Pande, работающей над механизмом конформационного изменения белков, связанного с различными заболеваниями, включая рак, нейродегенеративные и сердечно-сосудистые расстройства. Некоторые из ключевых результатов, полученных с помощью ресурсов Folding@Home на механизмах конформационных изменений: рецепторов, сопряженных с G-белком и Киназы, освещенные в предыдущих сообщениях блога.

Миссия моей группы совместить теорию, вычисления и эксперименты по разработке количественных моделей биологических явлений, имеющих значение для здоровья, энергетики и экологических проблем. Эти грандиозные задачи не только требуют новых научных методологий и идей, но и разработку платформ, которые позволят более широкое участие сообщества информированных граждан в погоне за решениями.
Folding@Home является одной из таких уникальных платформ, которая позволяет осуществлять взаимодействие с добровольцами и участниками, чтобы помочь решать сложные научные проблемы. Наша группа рада быть частью команды Folding@Home, и мы с нетерпением ожидаем совместной работы с Вами над проектами, связанными с основными проблемами здоровья человека. Конкретные детали проекта будут размещены в ближайшее время на форуме folding и блоге F@H.
Вложение:
Комментарий к файлу: Группа Shukla из Иллинойса
ShuklaGroupIllinois.jpg
ShuklaGroupIllinois.jpg [ 21.91 КБ | Просмотров: 5151 ]


Новое техническое обновление ядра: OpenMM (GPU) и Gromacs (CPU)
Vijay Pande, 29.05.2015 писал(а):
Мы много работали, чтобы улучшить производительность OpenMM, особенно OpenCL, использующийся сейчас в Folding@home. Мы имеем замечательные новости для прессы. Критерии теста производительности размещены по адресу http://wiki.simtk.org/openmm/BenchmarkOpenMMDHFR. Они используют самый последний код OpenMM, который будет в OpenMM 6.3. Они используют CUDA 6.5 и запущены на Titan X. Все числа в наносек\день
Тип теста Вычисление__CUDA___OpenCL
Implicit,---------2 fs----------471---------366
Implicit,---------5 fs----------684---------589
Explicit-RF,------2 fs----------305---------265
Explicit-RF,------5 fs----------508---------460
Explicit-PME,----2 fs----------161---------164
Explicit-PME,----5 fs----------318---------354
Мы особенно рады числам OpenCL PME. Ведущий разработчик OpenMM Peter Eastman много работал для этого релиза и сейчас оно быстрее, чем CUDA(для Titan X). Любопытно, что это не так для GTX 980. Оно все еще медленнее, чем CUDA, хотя уже намного лучше, чем раньше.

Это будет внедрено в обновлении ядра Folding@home. Для участников с GPU, PPD должно увеличиться, за счет расширения возможностей нового кода.

Важно подчеркнуть, что участники SMP/CPU не получат новой производительности(следовательно и PPD) в этом обновлении, ведущий разработчик Joseph Coffland усердно работает над новым ядром Gromacs и это должно дать преимущества в производительности, поскольку мы обкатываем поддержку AVX для FAH.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Проблема с веб-клиентом для Google Chrome
Vijay Pande, 06.06.2015 писал(а):
Мы видим, что есть проблема с нашим клиентом NaCl(http://folding.stanford.edu/nacl) участники видят такую ошибку:
"Warning: Unexpected response to AS assignment request: error,DB ERROR: IO error: log.leveldb/016519.ldb: Too many open files"
Сервер перегружен, наша команда системных администраторов посмотрит когда вернется в понедельник. В долгосрочной перспективе, сдается нам, что пришло время для модернизации сервера, т.к. запущенный перегружен. Мы должны получить и подготовить новые сервера в течении недели(сервера здесь, наша команда системных администраторов работает над подготовкой их к новым ролям в FAH).

От себя замечу, что проблема не только с веб-клиентом, но и с сервером статистики
Upd 09.06.2015: Статистика восстановлена, веб-клиент тоже

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


Последний раз редактировалось MegaCalcii 09.06.2015 13:26, всего редактировалось 2 раз(а).

 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 24.10.2002
Откуда: Петербург
Первая полная версия Folding@Home клиента для Android-устройств
Vijay Pande, 07.07.2015 писал(а):
#77 #77 #77 #77

С гордостью представляем первую полную версию нашего Folding@Home клиента для android устройств!
Эта версия доступна для всех телефонов с системой Android 4.4 (Kitkat) и выше. Благодаря предложениям участников проекта мы переделали пользовательский интерфейс и добавили новые возможности:
    * может работать непрерывно: достаточно просто подключиться к wifi и розетке
    * поддержка игровых сервисов Google дает возможность получать достижения и соревноваться с друзьями в количестве предоставленного времени
    * объединить предоставленные ресурсы с нескольких устройств в одном Google Game Services аккаунте
    * экран с настройками был убран, теперь в них нет необходимости!
    * описание текущего типа исследований можно вызвать нажатием на "Research Type" на главном экране или выбрав пункт меню "Active Research"

С научной точки зрения, в мобильном приложении мы по-прежнему (как и бета версии) сосредоточены на раке молочной железы. В этом проекте мы исследуем природу мутаций лекарственной устойчивости в ключевых белках (киназах). Изучение природы того, как эти мутации меняют ключевые цели медикаментов, позволит нам улучшить понимание биофизики этих белков и создать инструмент для выбора наилучшего лекарства для конкретного пациента.

Бета версия имела успех и получила положительные отзывы от нашего сообщества. В ближайшие месяцы мы планируем добавить дополнительные фичи для дальнейшего улучшения пользовательского интерфейса и опыта. Бета версия была загружена более 170000 раз по всему миру, более 62000 телефонов работали одновременно.

Благодарим наше сообщество за ваши отзывы и поддержку.

Также мы выложили новое видео для привлечения внимания к приложению:



 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 13.02.2015
Откуда: Златоуст
Фото: 18
Комментарии к новостям - только в порядке дополнения или исправления ошибок. Все другие обсуждения - в соответствующих темах форума.
От себя добавлю пример верного коммента:
Ссылка на скачивание для андроид

_________________
ASUS H110M-R/C/SI|G4600|Radeon R7 2х4Гб|GTX1050Ti Dual|AOC G2460PG G-Sync
MSI GP72 7QF-1002 17.3"FHD/i7-6700HQ/8G/1T/GTX960M-2G/DOS


Последний раз редактировалось MegaCalcii 09.07.2015 12:41, всего редактировалось 3 раз(а).
Комментарий удален, оффтоп


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Моделирование динамики белков для нахождения привязки компетентных структур
Vincent Voelz, 15.07.2015 писал(а):
Мутация в подавителя-опухоли белка p53 является общей чертой большинства видов рака. Белок MDM2, чья работа заключается в подавлении p53 через их прямое взаимодействие - поэтому это стало основной целью для терапии рака.
Обычно, небольшая винтовая область p53 связывает место рецептора MDM2, но если молекула с подобной формой может связать место рецептора MDM2 достаточно сильно это может предотвратить от связывания р53, что делает р53 более доступным для подавления опухоли.

Много различных видов молекулярных имитаторов спирали p53 были разработаны, чтобы разрушить p53-MDM2 взаимодействие, включая сшитые пептиды, циклические шпильки пептиды, бета-пептиды, пептоиды(N-замещенные олигоглицины), олигоариламиды, спиролегомеры. Эти молекулы намного больше, чем типичные мало-молекулярные лекарства и имеют интересные свойства сворачивания, которые необходимо преодолеть для достижения жесткой привязки. Сшитые пептиды, к примеру, имеют функцию углеводородной "скобы", которая помогает укрепить спиральное расположение в растворе, что в свою очередь увеличивает сродство.

С помощью молекулярного моделирования Folding@home мы изучили спаренное сворачивание и привязки спирали p53 к MDM2 чтобы обратиться к нескольким ключевым вопросам. Одна задача - понять роль конформационной динамики в формировании связанного механизма - такая информация в конечном счете может помочь проектировать лучше-связанные молекулярные имитаторы.

Еще один вопрос это можно или нельзя использовать моделирование молекулярной динамики для обнаружения компетентно-связанных структур рецепторов MDM2 в отсутствие связанной кристаллической структуры. В новой работе из нашей лаборатории ("Белки 2015" авторы:"Pantelopulos" и другие) мы показываем, что моделирования без лигандов MDM2, начиная со структур расщепления с закрытой привязкой можно попробовать способы расщепления с открытой привязкой. Мы также протестировали производительность нескольких недавних моделей силового поля в предсказании экспериментальных измерений NMR. Мы обнаружили, что все силовые поля выполняются так же хорошо, но большее время моделирования (выход за микросекунды) лучше согласуется с экспериментом.

Вы можете прочитать о нашей работе в последнем выпуске Белков:

Микросекунды моделирования MDM2 и его комплекса с p53 приводят к пониманию точности силового поля и конформационной динамики George A. Pantelopulos и Vincent а. Voelz. Белки: Структура, функции и биоинформатика (2015)

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Глобальная карта использования мобильного клиента FAH
Mark Piercy, 05.08.2015 писал(а):
Люди по всему миру помогают исследованию, скачивая и запуская Folding@Home mobile
Вот изображение глобального распределения использования нашего Мобильного Клиента, созданного членом группы Pande Muneeb'ом Sultan'ом. Это показывает все текущие связи от мобильных телефонов до нашего Рабочего сервера, в Стэнфордском университете, на текущий момент времени.
Карта
#77


_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 24.10.2002
Откуда: Петербург
15 лет Folding@home!
Vijay Pande писал(а):
Счастлив сообщить, что сегодня 15-й День Рождения Folding@home! Я испытываю удивительные ощущения, оглядываясь назад на все, что мы сделали вместе, и что все мы построили, и все что из этого получилось. От процессоров до видеокарт, PS3, NaCl и телефонов. И сегодня мы находимся в разгаре обновления веб-сайта FAH, внедрения новых мобильных и других (пока еще неанонсированных) клиентов, а также новых проектов изучения рака и болезни Альцгеймера.
И мы с нетерпением ждем празднования изменений на следующие 15 лет!

С днем рождения, Folding@home! #77


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Ген mTOR: Задания 10491-10499
Steven Albanese, 09.11.2015 писал(а):
В проектах 10491-10499 лаборатория Chodera взглянет на mTOR, киназу серина/треонина. Ген MTOR первоначально обнаружили в дрожжах в 1991 и назвали TOR1/2, потому что это был маркер рапамицина, противогрибковая маленькая молекула, отделенная от почвы на острове Пасхи в 1970-х. Докторами Sabatini, Snyder, Abraham, и Schreiber в 1994 в млекопитающих был обнаружен маркер рапамицина (mTOR).
Киназа и FAT область
#77

MTOR объединяет несколько сигнальных входов для управления процессами, таких как рост клеток и обмен веществ, среди прочих. Из-за его роли в управлении многими клеточными процессами, у mTOR есть клиническое значение при нейродегенеративных заболеваниях, диабете и раке.
В лаборатории Chodera мы работаем с лабораторией Hsieh в MSKCC(Онкологический центр Memorial Sloan-Kettering в Нью-Йорке прим. Calcii), чтобы понять роль mTOR в раке и развитии новой и лучшей терапии для него.

В настоящее время FDA одобрила лечение метастатической clear cell Renal Cell Carcinoma(ccRCC - рак почки, прим. Calcii), которая включает mTOR ингибиторы, такие как Эверолимус и Темсиролимус. Понадобились неимоверные усилия, чтобы понять изменения от пациента к пациенту в ответ на эти лекарства, изучая, как экстраординарные респонденты приводят к характеристике mTOR, активирующего бессмысленные мутации у этих пациентов. Эти мутанты группируются в двух областях mTOR: киназе и FAT областях(Focal Adhesion Targeting - Ориентация Фокуса Прилипания). Эти проекты позволят нам сформировать модель для mTOR и в конечном счете заниматься исследованиями, как эти клинически значащие мутации могли бы влиять на структуру белка.

И mTOR область киназы и еще большая конструкция, включающая FAT домен, являются очень большими системами, использующими последнее ядро OpenMM GPU (0x21) и возможности последнего поколения GPU в полном объеме.
MTOR мутант
#77


_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Проблемы с ядром FahCore_21
Vijay Pande, 20.11.2015 писал(а):
Мы обнаружили, что новый FahCore_21 производит больше ошибок, чем мы считаем приемлемым для некоторых клиентов. Коэффициент ошибок, кажется, зависит от нескольких факторов, но самое примечательное то, что оно не работает нормально со вторым поколением GPU Maxwell. Несколько проектов, предназначенных только для тестирования с ключом Advanced, были распределены всем с настройками "по умолчанию". Чтобы позволить участникам ограничить это воздействие, те проекты были переклассифицированы в Advanced, для которых ядро все еще находится в разработке.
Как и всегда, параметр Advanced даст вам доступ к новым проекты, которые могут иметь более высокий уровень ошибок. Это наше намерение предоставить только самые безопасные задания для настройки с параметрами "по умолчанию" или вы можете выбрать настройку вашей системы для запуска этих Продвинутых проектов в зависимости от того, как часто вы сталкиваетесь с этими ошибками. Ожидается, что эти условия, улучшат как новые проекты, так и новые версии ядер или новые версии драйверов, включая любые требуемые исправления. В то же время задания, которые будут успешно завершены, позволят добиться прогресса по научным исследованиям еще более сложных проектов, чем мы сделали до сих пор.

С 21 ноября примерно с 3 часов по тихоокеанскому времени(с 14 часов по московскому времени) обнаружена проблема с отображением статистики, скорее всего к понедельнику поправят. Прим. Calcii
24 ноября статистика восстановлена

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


Последний раз редактировалось MegaCalcii 24.11.2015 13:05, всего редактировалось 1 раз.
Статистика восстановлена


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Новая статья по сворачиванию пептоидной спирали от лаборатории Voelz
Vincent Voelz, 26.11.2015 писал(а):
Природа опирается на замечательные свойства сворачивания белков и нуклеиновых кислот для выполнения жизненно важных химических взаимодействий. Не удивительно, что химики-синтетики долго нацеливались на создание ненатуральных молекул - называемых фолдамерами - которые могут использовать подобные свойства сворачивания для множества разнообразных областей, включая наноматериалы, биотерапию и химические катализаторы.
Пептоиды (N-замещенные олигоглицины) являются био-обеспечением синтетических гетерополимеров, которые можно свернуть в целый ряд различных структурных платформ. В новом документе, Mukherjee et al., мы сообщаем о улучшения моделирования потенциалов, которые лучше модели пептоидных спиралей, и является ключевым Мотивом(Мотив — характерная последовательность нуклеотидов в нуклеиновых кислотах или аминокислот в полипептидах, часто выполняющая определенные функции прим. Calcii) для имитаторов пептида. Затем мы используем модель статистической механической спирали-катушки для изучения термодинамических сил, способствующих формированию спирали. Мы находим, что, в отличие от пептидов, пептоидные спирали могут увеличивать их энтропию после сворачивания, указывая на то, что их основная пространственная масса играет большую роль в стабилизации спиралей. Эти результаты в будущем помогут в вычислениях дизайна пептидов.
Только что принятая рукопись: http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.5b09625

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 08.08.2003
Откуда: Москва
Обновилась версия 21-го ядра. На ключ бета под линуксом идет 14-я версия. ппд заметно вырос. Скрины прилагаю.
Карты 2х980


Вложения:
Скриншот 2015-12-04 15.12.34.png
Скриншот 2015-12-04 15.12.34.png [ 678.31 КБ | Просмотров: 2966 ]
Скриншот 2015-12-04 15.12.26.png
Скриншот 2015-12-04 15.12.26.png [ 674.13 КБ | Просмотров: 2966 ]
Скриншот 2015-12-04 15.06.50.png
Скриншот 2015-12-04 15.06.50.png [ 788.3 КБ | Просмотров: 2966 ]
 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Достижения FAH в 2015 со взглядом на 2016 год
Vijay Pande, 06.12.2015 писал(а):
Мы достигаем конца 2015 года и как в предыдущих годах, я хотел бы подвести итоги для участников, что Folding@home (FAH) сделал в 2015 и куда мы движемся. В целом FAH всегда пытался раздвинуть пределы с точки зрения новой инфраструктуры программного обеспечения (новые клиенты, внешние интерфейсы программного обеспечения), новые алгоритмы, улучшающие точность наших подходов, и возможно самое главное области болезни, на которые мы ориентируемся и продвигаем. Вот краткое изложение того, что мы сделали в этом году и куда мы движемся.

Как и в 2015, ключевыми областями в 2016 будут инфраструктура, методы, точность и маркеры.
Ниже, в каждом разделе, после обновления для 2015, я дам мое видение куда движется FAH. Поскольку некоторые из этих элементов связаны с не объявленными инициативами партнеров, некоторые из них, к сожалению, будут в форме тизера(Извините – как всегда, эта часть будет гораздо более краткой, чем резюме результатов предыдущего года). Так, как мне пришлось анонсировать запуск мобильного клиента в январе 2015 в моих анонсах декабря 2014 года, хорошей новостью является то, что мы надеемся, что участникам не придется ждать слишком долго и некоторые из них будут официально объявлены в 2016 году.

Для тех, кто хочет увидеть все детали, пожалуйста, проверьте наши страницы, которые включают резюме, резюме неспециалиста, и связаны с определенными результатами исследования.

1) Инфраструктура FAH
Философия и видение. Как и в предыдущие годы, мы продолжили наш прорыв в развитии нового модуля и внешнего интерфейса программного обеспечения. Это позволило нам оставаться на переднем плане развития, но ввело больше нестабильности в FAH для участников, таким образом, это часто - трудный компромисс. Но, мои взгляды здесь состояли в том, что мы должны здесь раздвинуть пределы, и надеюсь мы можем сообщить, что FAH больше походит на часть научного оборудования такого как BMW, всегда изменяясь и улучшаясь, но за счет частых перемен и потрясений.

Новый Assignment Server(AS). Мы запустили новый AS в производство. Я лично немного задумался, поскольку был основным автором последнего куска исходного кода предыдущего AS. Однако за более чем 15 лет работы Folding@home, деятельность значительно выросла от меня и нескольких студентов, делающих все, до команды программистов, большой группы ученых, многих аффилированных лабораторий, а также системных администраторов, дизайнеров, и т.д.

Новый AS имеет некоторые ключевые особенности, которые имеют важное значение в этом «росте» версий FAH: старый имел некоторые весьма обременительные требования для обновления конфигурации (который работал хорошо, когда FAH имел 3 ученых), но теперь с более 20, нам нужен совершенно новый подход. Кроме того, новый AS допускает более эффективное распределение компьютеров участников FAH для решения проблем, а также дает возможность для более продвинутой аналитики.

Мобильный клиент. С нашим запуском нашего мобильного клиента (где под мобильными имеются ввиду телефоны и планшеты) мы окунулись в другой тип инфраструктуры. Мое видение для мобильных устройств это будущая тенденция в вычислениях: люди часто обходятся без помощи настольных компьютеров или ноутбуков в пользу мобильных, поэтому FAH должен развиваться в соответствии с этими тенденциями. В то время как текущие мобильные телефоны не имеют вычислительной мощности современных настольных и портативных компьютеров, разрыв быстро сокращается, благодаря возрастающей силе мобильных GPU. Таким образом наш мобильный клиент закладывает основу для потенциального будущего FAH. Также стоит отметить, что за первые годы нашего GPU клиента (о котором я говорю с гордостью, в нашей области он лидировал с большим отрывом и предшествовал другим GPU вычислениям, поскольку когда мы запустили Folding@home на GPU, CUDA еще не существовало), у клиента GPU также не было удивительной производительности. Но мне было ясно, что это взлетит, и ставка на сегодня сыграла. Конечно, слишком рано, чтобы узнать, что мобильный клиент будет следовать подобным путем, но я чувствую, что важно сделать на это ставку.

Браузерный клиент(NaCl). NaCl клиент является своего рода экспериментом сродни мобильному. Он делает легкой установку через наш веб-сайт, с помощью браузера Chrome. Следующие шаги для роста это работа над вирусными маркетинговыми кампаниями, чтобы вывести слово в топ.

Обновления Work Server(WS). Наконец мы продолжили вносить улучшения в WS. Эти улучшения, как правило, видимы только для исследователей, но и это очень много для основы работы FAH и мы будем продолжать упрощать использование WS (упрощения для настройки исследователями), более мощные функции (в обслуживании научных расчетов), а также более мощные способности в раздаче заданий WUs ( улучшения скорости от архитектурных перестроек, что даст серверу обрабатывать больше участников).

Обновления системы статистики. Наконец мы сделали некоторые обновления статистики системы, для упрощения внешнего интерфейса. Это привело к меньшим проблемам статистики и быстрым ответам в решении проблем.

Видение 2016. Как подробно описано выше, цель сохранить FAH на острие прогресса и максимально использовать вклад участников с научной точки зрения.

Новые клиенты. Мы будем надеяться на более широкое продвижение мобильных клиентов. (Извините, что не раскрываем здесь больших подробностей, но мы делаем много совместных объявлений с нашими партнерами)

Новое ядро Gromacs. Ядро Gromacs продолжает быть рабочей лошадкой для CPU клиентов, и мы работаем на выпуском обновленного ядра с более широкой аппаратной поддержкой, включая поддержку AVX, которая даст некоторым участникам автоматическое увеличение производительности.

WS, чтобы сделать науку более передовой. Вместе с новыми методами ниже, мы будем выдавать новые особенности WS, такие как высокочастотная адаптивная выборка (см. ниже).

Более продвинутая аналитика. Мы работали над этой областью некоторое время, и она часто помещается позади других приоритетов, но это становится большей и большей потребностью для нас, чтобы мониторить FAH улучшенным способом.

Новая система статистики. Учитывая все другие работы по инфраструктуре, это возможно произойдет в 2016 году, но мы признаем это как ключевую потребность. Это последняя часть FAH, которая очень стара и давно не имела обновлений.

2) Новые методы

Философия и видение. Так как FAH существует давно, то часто воспринимается, что можно использовать огромное количество слабо сочетающихся процессоров для огромных вычислений. Но это отнюдь не легко. В самом деле, когда я впервые предложил FAH, многие люди говорили, что это фактически невозможно. И в некотором смысле это было так – это было бы невозможно использовать несколько процессоров, делая традиционные распараллеливания по нашим расчетам, так как это требует супер высокой пропускной способности, низкую задержку сети. И в первые годы FAH, много людей были даже на модемах (да! Легко забыть на что жизнь походила в 2000).

Ключевой частью нашего успеха с FAH раздвигала пределы для использования ресурсов FAH, чтобы осуществить больше и больше идей, т.е. более сложные системы, больше прогнозирующих моделей, и т.д. И этот год был особенно плодотворным в достижениях в этой области. Кроме того, методы, которые мы развиваем здесь очень естественно, были применены к облачным вычислениям, далее расширив научный прогресс FAH.

Модели состояния Маркова (МСМ). За последние 10 лет наши лаборатории (и несколько других) впервые применили МСМ методы и они в последние годы достигли совершеннолетия, став во многих случаях золотым стандартом для распределенных вычислений. В частности было несколько ключевых достижений Роберта Макгиббона и других исследователей в моей лаборатории, которые позволили сделать создание МСМ полностью автоматизированным, а также быть более точными. Наш код МСМ является полностью открытым исходным кодом, доступен на http://msmbuilder.org.

Продвижения OpenMM. Наконец, основой наших самых новых клиентов (GPU и мобильного) является OpenMM, наша высокая скорость кода молекулярной динамики. OpenMM получен на основании оригинального кода GPU от Folding@home и теперь используется в работе многих других исследователей. В этом году усовершенствования OpenMM позволили нам работать на современных GPU, улучшив скорость, и улучшив точность (примечание изменения доступны на
странице OpenMM github). OpenMM - полностью открытый исходный код, доступный на http://openmm.org

Видение 2016 года. Как описано выше, надо продвинуть наши способности в создании новой науки, и особенно учитывая чрезвычайные алгоритмические проблемы распределенной архитектуры.

Достижения МСМ. Мы продолжаем получать достижения в МСМ, особенно в связи с современным машинным продвинутым обучением. Это также даст нам большой импульс в нашей способности глубже понять смысл в результатах FAH.

Адаптивная выборка. Адаптивная выборка играет ключевую роль во многих вычислениях FAH, но она была сделана с применением большого количества ручной работы руководителей проектов WS. Теперь, в сочетании с новой инфраструктурой это будет автоматизировано.

OpenMM. Разработка OpenMM будет продолжать развиваться в сторону большей скорости и функциональности, принудительно в улучшении скорости для продвинутой точности силового поля AMOEBA и поддержки AMOEBA в Folding@home. Оба будут идти с OpenMM 7.0, которые будут внедрены в новое ядро (вероятно Core22).

3) Более точные модели

Философия и видение. Ключевая проблема в моделировании в целом это напряженность между точностью и вычисляемостью. Здесь, я особенно говорю о модели, которую мы используем, чтобы вычислить силы между атомами в наших моделированиях. Можно было выбрать очень точную модель, но тогда мы бы не в состоянии были сделать много вычислений (в химии, самые точные модели, например, FCI, могут обрабатывать только несколько атомов, а в FAH мы хотим моделировать сотни тысяч взаимодействующих атомов). Мое видение было двигаться в обоих направлениях – для разработки моделей высокой производительности, которые значительно бы улучшили точность, и эта точность больше, чем в значительно более дорогих подходах. В этом году я увидел первые плоды этой инициативы, которая была начата несколько лет назад, и как многие FAH инициативы, участники увидят результаты только в самом конце (Извините, это характер исследований – мы ничего не можем показать, пока это не будет готово к публикации). Но первые результаты этой инициативы очень захватывающие, с большой надеждой на предстоящие годы.

Сначала вода. Наши первые улучшения моделей идут с нашим силовым полем для воды, во главе с доктором Ли-Пином Ваном, который является теперь преподавателем в Отделе Химии в UC Davis. Вода очень фундаментальна для всех наших моделирований, это естественное место для начала. Наша водная модель значительно более точна, чем предыдущие из-за радикально нового подхода, где мы используем тяжелые вычисления и статистические методы для фундаментальных достижений, мало чем отличаясь от МСМ, которые также помогли, хотя и в другой области.

Видение 2016 года. Более широкая разработка силовых полей. Выход за пределы воды, мы ожидаем перестроение силовых полей через расширение с широким воздействием в наших вычислениях для FAH. FAH будет также играть ключевую роль в количественном понимании улучшений, которые приносят эти силовые поля.

4) Цели болезней.

Философия и видение. В выборе целей, т.е. областей болезней, где мы используем Folding@home, чтобы сделать открытия, мы выбирали области, где было бы существенное влияние, и где FAH может помочь большинству. В общем проекты FAH работают очень долгое время и это занимает много вычислительной мощности для решения многих вопросов. Поэтому я опишу ниже новые области.

Киназы (ключ к раку) теперь становятся общим местом.Киназы являются ключевыми для многих методов лечения рака, клетки растут неконтролируемо и ингибирование киназы может остановить это. В прошлом, киназы были недоступными для FAH (и мне нравится подталкивать команду для достижения цели), но теперь они являются очень распространенным явлением и даже во многих случаях относительно «легких» целей. Это означает, что мы можем настойчиво следовать за многими из них, особенно в сотрудничестве с ключевыми экспериментаторами. У нас была ключевая опубликованная работа про киназы и еще больше в процессе написания.

Каналы. Ионные каналы являются также интересными целями, с очень широкой фармакологией и болезнями. Однако это очень большие и сложные системы, киназы станут досягаемы для использования, так что это область за которой надо смотреть, особенно в 2016 году.

Видение 2016 года. Как обсуждалось выше, мы продолжим движение к большим и более сложным системам, надо надеяться на каналы, с которыми становится намного легче, как это было с киназами. Кроме того, я работаю над способами, которыми мы можем поделиться с партнерами из других групп, включая группы из pharma, для “общедоступной” науки в этом пространстве, делая результаты полностью доступными, улучшая способности всего сообщества влиять на болезни. Извините, что так кратко, главные объявления, такие, как про программное обеспечение, мы придерживаем до тех пор, пока мы не готовы их представить.

В итоге. Я хотел бы поблагодарить всех наших участников за их вклад в Folding@home. Это вдохновляет меня на обсуждение этих удивительных результатов и 15 лет назад я не мог себе представить, что мы смогли сделать то, что мы делаем сейчас, и я очень взволнован как наше видение и планы на будущее смогут подтолкнуть нас еще дальше.

PS Для тех кто хочет увидеть все подробности, пожалуйста, проверьте все наши документы страницы, которые включают в себя резюме, резюме неспециалистов и ссылки на результаты конкретных исследований.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Новая статья о эффектах искусственного соляного мостика при сворачивании
Vincent Voelz, 01.01.2016 писал(а):
Электростатические взаимодействия между положительно заряженными остатками цепей (такими как Аргинин или Лизин) и отрицательно заряженными цепями (такие как Аспарагиновая или Глутаминовая кислоты). Они играют важную роль в стабилизации многих структур белка и, как было показано, используются для расчета конструкции белка.

В этой работе мы изучаем эффекты искусственных солевых мостиков при сворачивании растворимой спирали пептида, основанной на аланине (Пептид Fs), используя обширное все-атомное молекулярное моделирование динамики, выполняемое на распределенной вычислительной платформе Folding@home.

Используя модели Маркова, мы показываем как искусственные солевые мостики влияют на кинетику сворачивания Fs пептида, вызывая определенные конформационные состояния. Кроме того, мы представляем методы для автоматического обнаружения и анализа таких состояний.

Почему эти результаты важны для понимания сворачивания белка? Раньше считалось, что белки в развернутом состоянии похожи на "случайную катушку" с несколькими структурными особенностями. Теперь мы знаем, что солевые мостики, образующиеся в не свернутых состояниях могут существенно влиять на стабильность и динамику сворачивания. Наша работа показывает, что мы можем количественно предсказать эти эффекты. В конечном счете, мы надеемся использовать эти знания, чтобы проектировать свойства сворачивания белков.

Только что принятая рукопись: http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.5b11767

Солевой мостик
#77

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 24.10.2002
Откуда: Петербург
Плановое отключение 28 февраля
Vijay Pande 24.02.2016 писал(а):
В это воскресенье, 28 февраля c 0 до 4 утра* мы будем проводить апгрейд сетевой инфраструктуры. Эти работы затронут и некоторые ключевые части проекта F@H. Наш сайт будет оффлайн какое-то время. Точное время отключения неизвестно, оно займет 5-10 минут и произойдет где-то в указанном интервале.

* 28 февраля с 11 до 15 часов по московскому времени


 

Куратор темы
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
Приближаемся к 100 Петафлопсам
Vijay Pande 11.05.2016 писал(а):
С тех пор как мы обновили отчет GPU в FLOPах(количество операций с плавающей запятой) Фактически 26 февраля 2013 года. В течении 3-х лет в GPU-вычислениях был достигнут значительный прогресс . За последние 3 года в FAH установилось несколько тенденций, особенно сосредоточение людей на GPU-вычислениях и увеличение мощности от них. Получается, что сегодня, в FAH работает около 40 000 GPU. Хотя это не большое количество участников, но это огромное количество вычислительной мощности. Во FLOPs'ах мы приближаемся к 100 петафлопсам, что станет важной вехой в вычислениях. С точки зрения нашей способности решать сложные задачи, мы оперируем гораздо большими мощностями, более комплексными системами, в течение более длительного времени, чем когда-либо прежде, что, возможно, является наиболее важной частью, а не просто голым увеличением количества чисел.

Спасибо всем, кто помог сделать это возможным. Мы будем чаще обновлять статистику этой страницы, чтобы не было больших скачков и это не было неожиданностью для людей.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Новая тема / Эта тема закрыта, вы не можете редактировать и оставлять сообщения в ней. Закрыто  Сообщений: 260 • Страница 12 из 13<  1 ... 9  10  11  12  13  >

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 2


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Перейти:  





Создано на основе phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB | Kolobok smiles © Aiwan


Яндекс.Метрика