Часовой пояс: UTC + 3 часа




Начать новую тему Новая тема / Ответить на тему Ответить  Сообщений: 1772 • Страница 88 из 89<  1 ... 85  86  87  88  89  >
  Пред. тема | След. тема 
В случае проблем с отображением форума, отключите блокировщик рекламы
Автор Сообщение
 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 23.12.2006
Откуда: Rīga
Фото: 0
Vaga это, конечно, похвально, но простаивая на картах тоже ничем не помогаем. Лучше тогда уже считать другие проекты. На фолдинге проекты не заканчиваются.



Партнер
 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.06.2008
Откуда: Петрозаводск
Да, из медико-биологических - для видеокарт есть ещё и GPUGRID, а для центральных процессоров: TN-Grid

_________________
http://vk.com/boinc - всё о распределённых вычислениях.


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 20.10.2014
Фото: 12
Cancer Computer использует списанные серверы для борьбы с раком и коронавирусом
https://servernews.ru/1006585

_________________
TSC! Russia - добровольные распределённые вычисления.
Не используемые мощности твоего ПК могут помочь науке и людям в борьбе с тяжелыми заболеваниями.


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.06.2008
Откуда: Петрозаводск
Сейчас, кто хорошо знает английский, надо на форумах математических проектов усиленно агитировать, чтобы они бы временно перешли бы на медико-биологические проекты.

_________________
http://vk.com/boinc - всё о распределённых вычислениях.


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 11.02.2003
Мне кажется что итак все сознательные люди перешли
а если нет то и смысла нет их агитировать

_________________
Ещё не придумал...


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 01.04.2012
Откуда: St. Petersburg
Фото: 4
Vaga писал(а):
итак все сознательные люди перешли

Нууу тут дело такое… Многие не знают, ни что такое биткойн, ни как его майнить. А ведь эта тема хайпилась даже по ТВ продолжительное время, законы касаемо майнеров писались/принимались…
А про распределенные вычисления и вовсе никто не в курсе.
З.Ы. да, если и были бы в курсе - альтруизм дело такое, мягко говоря не для всех.
Особенно в нищих странах, как наша..

_________________
R9000(R200) -> R9600(R300) -> X1950Pro(R520) -> HD3650(R600) -> HD4830(R700) -> HD 7950 -> HD 7950 + R9 280X -> RX 580


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 17.06.2008
Откуда: Москва
Фото: 10
Альтруизма у нас мало.....
Ещё и мосэнергосбыт своими тарифами последнее желание отобьёт :mad2:

_________________
Вместе мы СИЛА!


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 01.04.2012
Откуда: St. Petersburg
Фото: 4
bootvirus ну так дело не для всех.. кто-то могёт.. вон в топах сидят дядьки (я не именно про нашу команду, скорее в целом) с 5-10 компами с TR 39xxX, Эпиками 74xx, GTX 1080Ti, RTX 2070 и выше..

_________________
R9000(R200) -> R9600(R300) -> X1950Pro(R520) -> HD3650(R600) -> HD4830(R700) -> HD 7950 -> HD 7950 + R9 280X -> RX 580


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 20.10.2014
Фото: 12
TN-grid так же что-то выкладывает по SARS-CoV-2
http://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=265

_________________
TSC! Russia - добровольные распределённые вычисления.
Не используемые мощности твоего ПК могут помочь науке и людям в борьбе с тяжелыми заболеваниями.


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 04.06.2004
Откуда: Мск.
https://pikabu.ru/story/chem_zanimaetsya_rosettahome_tsc_russia_5784228
Кто то из команды пару лет назад на пикабу запостил рекламу и нахватал минусов, но самое забавное что в комментариях некто Singularity2017, 7 месяцев назад отписался: "Все идиоты отписались? Я надеюсь вы вскоре попадёте в больницу с болезнью, которую не лечат". В свете последних событий выглядит немного пророчески .


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 01.04.2012
Откуда: St. Petersburg
Фото: 4
sukhanovsergey писал(а):
В свете последних событий выглядит немного пророчески .

Билл Гейтс лет 5 назад говорил про корону (не sars-cov-2, а в целом как семейство) и другие вирусы, и говорил, что мы оч. мало в нее инвестируем, и что это оч. скоро нам аукнется. Все так же болта забили на его выступление.

_________________
R9000(R200) -> R9600(R300) -> X1950Pro(R520) -> HD3650(R600) -> HD4830(R700) -> HD 7950 -> HD 7950 + R9 280X -> RX 580


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.06.2008
Откуда: Петрозаводск
Вот, посмотрите тему на форуме: https://boinc.ru/forum/topic/agitacziya ... ostid-1871

(Там в этом сообщении идея заключается, чтобы обратиться к разработчикам Яндекса). Это ещё один новый путь к популяризации вычислений. Может у кого появится идея, как развить этот путь, эту идею?

_________________
http://vk.com/boinc - всё о распределённых вычислениях.


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.06.2008
Откуда: Петрозаводск
Уже давно всех просил, давайте массово обратимся к разработчикам Driver Pack Solution, чтобы они в состав предлагаемого программного обеспечения включали бы BOINC - давайте массово просить их об этом.

==============


А ещё как вариант - в статьи wikipedia про коронавирус:

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0 ... F_COVID-19
https://ru.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV-2
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0 ... 1%81%D1%8B

написать о том, что поиском лекарства занимаются Rosetta@Home Folding@Home и World Community Grid

Кто-нибудь напишет туда 1 - 2 но толковых предложения про это?

(И кстати слева есть выбор тех же страниц, но на других языках)!

Это было бы хорошее продвижение проектов.

_________________
http://vk.com/boinc - всё о распределённых вычислениях.


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 23.12.2006
Откуда: Rīga
Фото: 0
Это не совсем правильный метод, потому что установка стороннего софта никогда не проходила успешно (в плане одобрения пользователя). Ситуация будет напоминать именно те случаи, когда ты устанавливаешь какую-то программу, а тут сразу предлагает установить какой-нибудь Avast, Yandex или ещё какой мусор. Точнее даже не предлагает, галочка уже стоит , и невнимательные пользователи просто жмут "далее" и устанавливают их, а потом удивляются, откуда на компе столько мусорных программ. Конечно, BOINC мы никак в разряд таких программ не вносим, но это мы, кранчеры. А вот простой пользователь, когда увидит на компе этот софт, просто снесет его , даже не разбираясь 99%. Так что идея из рязряда мусорных и слишком навязчивая.


Последний раз редактировалось sashmxm 17.04.2020 9:34, всего редактировалось 1 раз.

 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.06.2008
Откуда: Петрозаводск
Здесь есть целая ветка идей по пропаганде BOINC на английском языке: https://boinc.berkeley.edu/forum_forum.php?id=16

_________________
http://vk.com/boinc - всё о распределённых вычислениях.


 

Junior
Статус: Не в сети
Регистрация: 17.03.2018
Откуда: Тюмень
sukhanovsergey писал(а):
Кто то из команды пару лет назад на пикабу запостил рекламу и нахватал минусов, но самое забавное что в комментариях некто Singularity2017, 7 месяцев назад отписался: "Все идиоты отписались? Я надеюсь вы вскоре попадёте в больницу с болезнью, которую не лечат". В свете последних событий выглядит немного пророчески .



Это был я...

_________________
https://boinc.ru/forum/ Распределенные вычисления на благо науки!


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 04.06.2004
Откуда: Мск.
Иммунная математика.
Как матмодели помогают создателям вакцин.

Работа выполнена группой, в состав которой вошли Дмитрий Гребенников и Геннадий Бочаров из Института вычислительной математики РАН, руководитель Междисциплинарного научного центра «Математическое моделирование в биомедицине» РУДН Виталий Вольперт, Николай Бессонов из Института проблем машиноведения РАН, а также Анасс Бушнита из Швеции и Андреас Майерханс из Испании.
Они одними из первых в мире успешно объединили в рамках единой модели математический аппарат теории вероятности, диффузионные модели, дифференциальные уравнения и другие методы и смогли описать условия, при которых антиген-специфические Т-лимфоциты успевают встретить и идентифицировать ВИЧ-инфицированные клетки до того момента, когда размножающиеся вирусные частицы начнут распространяться по организму

https://nplus1.ru/material/2020/04/29/maths-for-hiv


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 04.06.2004
Откуда: Мск.
Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты — 2
Об авторах
Тимур Исмаилович Маджидов — кандидат химических наук, старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории хемоинформатики и молекулярного моделирования Химического института имени А. М. Бутлерова Казанского федерального университета. Область научных интересов — хемоинформатика, квантовая и вычислительная химия, большие данные в химии, использование методов машинного обучения и искусственного интеллекта в химии.
Георгий Фёдорович Куракин — ординатор кафедры биохимии с курсом клинической лабораторной диагностики Тверского государственного медицинского университета. Область научных интересов — биохимия, молекулярная биология, биоинформатика, хемоинформатика. Лауреат конкурса «Био/мол/текст-2019».

https://elementy.ru/nauchno-populyarnaya_biblioteka/435339/Kompyuternye_tekhnologii_protiv_koronavirusa_pervye_rezultaty_2


 

Junior
Статус: Не в сети
Регистрация: 17.03.2018
Откуда: Тюмень
sukhanovsergey писал(а):
Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты — 2
Об авторах
Тимур Исмаилович Маджидов — кандидат химических наук, старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории хемоинформатики и молекулярного моделирования Химического института имени А. М. Бутлерова Казанского федерального университета. Область научных интересов — хемоинформатика, квантовая и вычислительная химия, большие данные в химии, использование методов машинного обучения и искусственного интеллекта в химии.
Георгий Фёдорович Куракин — ординатор кафедры биохимии с курсом клинической лабораторной диагностики Тверского государственного медицинского университета. Область научных интересов — биохимия, молекулярная биология, биоинформатика, хемоинформатика. Лауреат конкурса «Био/мол/текст-2019».

https://elementy.ru/nauchno-populyarnaya_biblioteka/435339/Kompyuternye_tekhnologii_protiv_koronavirusa_pervye_rezultaty_2



Супер статья!

_________________
https://boinc.ru/forum/ Распределенные вычисления на благо науки!


 

Junior
Статус: Не в сети
Регистрация: 17.03.2018
Откуда: Тюмень
Исследования структуры белка в проекте CAS@home
Область исследований: структура белка
Институт: Институт вычислительных технологий, CAS
Применение: TreeThreader
Введение
Понимание структур и взаимодействий белков необходимо для понимания их механизмов и, следовательно, необходимо для полного понимания жизненных процессов на молекулярном уровне. В настоящее время более семи миллионов случаев белка достигают точности ЯМР среднего разрешения, или последовательности помещаются в базу данных UniProtKB / TrEMBL, но только 50000 из них имеют экспериментально решенные структуры. Высокий спрос сообщества на белковые структуры поставил компьютерное прогнозирование белковой структуры, на беспрецедентно важную позицию.
Однако для предсказания структуры белка требуется огромное вычислительное время. Например, многопоточность, ведущий метод прогнозирования структуры белка, занимает очень много времени, поскольку последовательность запросов должна быть выровнена по всему шаблону в базе данных. Работа на добровольных началах - это просто отличный шанс для предсказания структуры белка.
Наша цель - разработать новую практическую программу потоков, которая может учитывать парное взаимодействие. Доказано, что общий случай (рассматриваются все парные контакты) задачи NP-труден. Итак, мы обратимся к использованию вложенного графа для описания частей контактов шаблона (так же, как ковариационная модель для анализа вторичной структуры РНК), что может быть выведено с точки зрения вычислительной эффективности.
Учитывая шаблон T и последовательность запросов S, структура программы выглядит следующим образом:
Представлять шаблон несколькими вложенными графиками.
Здесь мы используем итеративный алгоритм для решения этой проблемы, в каждом раунде используем динамическое программирование для построения оптимального вложенного графа и удаляем все содержащиеся в нем контакты из исходного графа контактов.
Выровняйте каждый вложенный граф с последовательностью запросов.
Мы используем CRF (условные случайные поля) для моделирования этой проблемы. CRF - это вероятностная модель, и ее можно легко добавить.
Объединить выравнивания вместе.
Каждый вложенный граф даст выравнивание между шаблоном и запросом. Мы можем объединить их в одно выравнивание на уровне апостериорной матрицы вероятностей, используя технику вероятностной согласованности, или построить окончательную модель независимо, используя MODELLER, и затем выбрать лучшую.
Прогресс
Спасибо всем вам! Мы завершили первую версию TreeThreader. Хотя контактная информация о дальнем расстоянии еще не рассматривается, эта версия имеет сопоставимые характеристики по сравнению с современными методами, такими как HHpred.
Мы рассмотрим дальнейшие контакты и учтем эту информацию в нашей следующей версии TreeThreader. Кроме того, наш TreeThreader принял участие в CASP10 (Эксперимент в сообществе, по критической оценке, методов прогнозирования структуры белка), одном из конкурсов прогнозирования структуры, в котором тестируется большинство современных методов. Мы сообщим о нашей работе в CASP10, как только будут опубликованы официальные результаты CASP10.
Моделирование молекулярной динамики
Введение
LAMMPS - это пакет моделирования молекулярной динамики с открытым исходным кодом, распространяемый SandiaNationalLaboratories.
Благодаря CAS @ Home, исследовательская группа в CNMM, Университет Цинхуа, использует универсальный интерфейс передачи заданий LAMMPS для запуска нескольких различных проектов, которые требуют крупномасштабного моделирования молекулярной динамики.
Первый проект LAMMPS, который будет запущен подобным образом CNMM, направлен на выполнение атомистического моделирования для изучения диффузии и транспорта молекулярного газа через наноразмерные каналы. Исследователи этого проекта - Ю Ван и Йозеф Эллингсен, главный исследователь - ЧжипинСюй.
Мотивация этого исследования заключается в разработке высокоэффективной и недорогой фильтрации для удаления летучих органических соединений (ЛОС) из азота и кислорода. Другими словами, это фундаментальное исследование новых способов фильтрации потенциально опасных химических веществ из воздуха, которым мы дышим.
Исследуемые фильтры основаны на иерархических сетях с участием наноструктурированных материалов. Расчеты, выполненные добровольцами, при статистическом анализе могут обеспечить профили свободной энергии для молекулярной диффузии.
Интерфейс передачи заданий LAMMPS / BOINC, используемый в этих исследованиях, разработан в сотрудничестве между Институтом физики высоких энергий, CAS, Лабораторией космических наук, Калифорнийский университет в Беркли, и CNMM, Университет Цинхуа. Интерфейс LAMMPS / BOINC доступен для других ученых для использования и адаптации для собственных исследований. Для получения дополнительной информации, пожалуйста, свяжитесь с CAS@home.
Пекинский электронный позитронный коллайдер
Введение
BES является детектором общего назначения, работающим на BEPC (Пекинский электронный позитронный коллайдер), и был запущен в строй в 1984 году, а производство - в 1989 году. Основные обновления были применены как на BEPC, так и на BES в период с 1995 по 1998 год, следовательно, BEPC обновлен до BEPCII, и BES является BESII и BESIII. BESIII - текущий детектор, работающий на BEPCII. BES - это первая экспериментальная установка для физики элементарных частиц, разработанная и реализованная в самом Китае и включающая несколько субдетекторов. Как детектор, BES составляет около 6 м в длину, 7 м по высоте и ширине и весит около 500 тонн. BESIII применяет множество передовых технологий детекторов из разных стран мира и подобен «глазу» BEPCII для захвата и измерения субчастиц, образующихся при столкновениях e + и e-, для изучения основной единицы и взаимодействия между частицами вещества на уровень микроструктуры. BESIII является единственным в мире детектором, который работает в области энергий от 2 до 5Gev, и около 200 физиков из 27 мировых исследовательских институтов присоединились к сотрудничеству BESIII для проведения исследований по физическим теориям, таким как сильные взаимодействия и слабые взаимодействия в области энергии Тау-Шарм.
Как и в других расчетах HEP-эксперимента, для BESIII обычно существует 3 вида вычислений:
Имитационные вычисления (также называемые вычислениями Монте-Карло): для имитации столкновений, происходящих внутри детектора.
Реконструкция вычислений: передача необработанных данных, полученных с детектора или сгенерированных с помощью моделирования, в данные с физическим значением.
Анализ Вычисления: Тест против физических теорий, основанных на восстановленных данных.
Среди всех этих 3-х вычислений BESIII SimulationComputing является наиболее подходящим для волонтерских вычислений, потому что для этого требуются очень ограниченные входные данные. Однако программное обеспечение, которое используется для запуска BESIII-моделирования (BOSS, BES OfflineSoftware), очень зависит от платформы, поэтому для выполнения заданий BESIII-вычислений в BOINC необходимо использовать технологии виртуальных машин.
Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru/forum/

_________________
https://boinc.ru/forum/ Распределенные вычисления на благо науки!


Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Новая тема / Ответить на тему Ответить  Сообщений: 1772 • Страница 88 из 89<  1 ... 85  86  87  88  89  >
-

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 9


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Перейти:  



Лаборатория














Создано на основе phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB | Kolobok smiles © Aiwan