Купил корпус cougar panzer max

Я новичёк в этом деле,но в комплекте шлё всего 2 пенька

Также в комплекте шли какие то резиновые прокладки(пробовал установить на них,но они постоянно съезжали)

Места в корпусе где должны быть пеньки немного приподняты т.е я могу установить материнку сразу на крышку корпуса?

да

Смотрю фото на офф сайте - да, можно вкручивать прямо так.

А прокладок много? Возможно следует прикрутить через них, чтобы неиспользуемые места под болты ничего не закоротили.
Хотя врядли, пеньки как раз для опциональных точек крепления, которые отсутствуют на некоторых платах.

Если порты на материнке и отверстия в заглушке совпадают - ничего подкладывать не надо.