Данная мать имеет 6 сата портов, 4 других заняты, работают отлично, в том числе SATA 3_3, который отключается если ставить M.2_2, но она не установлена.
Не хотят работать порты, которые в биос имеют порядковый номер 2 и 3 (0,1,4,5 работают), а маркировку на материнке SATA3_A1 и SATA3_A2.
Попробовал уже все комбинации и разные провода, все рабочее, но в этих портах не определяется.
Хотя из 10 разных попыток 2 раза определились все таки все диски! Но после перезагрузки он опять исчезает. Так и не понял что это было.

Нашел около похожую проблему (ASRock LGA1151/2 на чипсете Intel Z370/Z390 (Coffee Lake)) где жаловались на эти А1 А2 порты,
но там они хотя бы как то определялись, у мени не видит ни в биос на в винде диск.

В чем причина проблем с портами SATA A1 и A2?

Нашел на сайте произодителя что они отличаются, но что именно это значит еще бы понимать)
- 4 x SATA3 6.0 Гб/с, с поддержкой функций RAID (RAID 0, RAID 1 и RAID 10), NCQ, AHCI и Hot Plug*
- 2 x разъема SATA3 6.0 Гб/с, обеспечиваемых чипом ASMedia ASM1061, с поддержкой функций NCQ, AHCI и Hot Plug
ну вот 4 работают, а эти 2 нет видимо...

Стоят M.2_1 Ultra NVME
3 HDD
1 SSD
+1 SSD пытаюсь вот подключить

Ну так проверь в биосе этот ASMedia включен или нет.

Все перерыл в биосе, никакого упоминания ASMedia чтобы включить или выключить там нет. Единственное что можно вкл выкл это Hot Plug

как это нет, смотри мануал пункт 4.4.4.

в моей версии UEFI P6.40 НЕТУ ! ))
(во вложениях фото)

чисто классика, когда открываю любое руководство у меня тупо чего то нет или не работает какой то пункт.)..

чисто классика, нет ни одного гайда по конкретному биосу. приходится самому разбираться. и с каждым годом, и каждой новой системой биос всё сложнее и запутанней. В общем, если не понимаешь - не лезь. Это для избранных гуру. Обычному юзверю достаточно настроек по умолчанию.

С каких пор настройки биоса это для гуру)) у меня там даже русскитй язык есть, хотя не нужен. Я там все понимаю, но там нет просто нужной настройки которую можно было бы включить.
Хз почему в старой версии биоса она была, видимо для старых операционок, а потом убрали - стало не актуально с выходом 7ки и тд. Я читал это нужно было для установки XP

Advanced,СPU Configuration,SVM Mode-Enabled. Advanced,Northbridge Configuration,IOMMU-Enabled.

первый параметр был уже включен, а второго опять же нет нигде в мой БИОС)

может такой путь есть Advanced \ AMD CBS \ NBIO Common Options \ NB Configuration \ IOMMU?