А ради чего такие извращения?

1. Возьмем к примеру контур здорового человека: радиатор/1 помпа/2 водоблока/резервуар. Если в контуре нету каких то извращений из супер-пупер-ультра-мега-резистивных компонентов, то поток будет ~200 литров при максимальных оборотах помпы(зависит от компоентов т.е. при низкой резистивности легко может быть и 300). Если добавим в контур вторую помпу, то поток вырастет на ~30% - т.е. будет ~260 литров в час.
При таком потоке жидкость пройдя через 2 водоблока и потреблении 450вт нагреется на 1,5 градуса.
радиатор - 30 градусов - CPU(150вт) - 30.5 градуса - GPU(300вт) - 31,5 градуса - резервуар - радиатор
Т.е. в радиатор поступает жидкость 31.5 градусов.

2. Ваш случай - контур "хрен знает зачем" - радиатор/помпа+водоблок и помпа+водоблок/резерувар. При параллельном подключении насосов в замкнутом контуре поток вырастет на ~70% но т.к. мы частично поделили сопротивление на ветки, то на ~90%.
Т.е. станет 380 литров в час в основной части контура. Но при этом поток делится на 2 рукава и в каждом из них он будет 190 литров. Чем ниже поток - тем выше нагрев жидкости при прохождении водоблоков. И мы получаем следующее:
Т.к. у нас скорость потока в радиаторе выше, то дельта вход/выход из радиатора станет немного меньше и на выходе из радиатора мы получим примерно 30.2 градуса. Т.е.
радиатор - 30.2 градусов - CPU(150вт) - 30.90 градуса - резервуар - радиатор
радиатор - 30.2 градусов - GPU(300вт) - 31.55 градуса - резервуар - радиатор
После смешивания в резервуаре мы получим жидкость 31.2 градуса на входе в радиатор.
Ура победа - мы вроде выиграли 0.3 градуса.

Температура жидкости в водоблоке это одно, а температура компонента это другое. Т.к. она рассчитывается как максимальная температура жидкости в водоблоке + нагрев компонента выше температура жидкости. Т.е. имеем:
CPU греется выше температура жидкости на 40 градусов. А GPU на 20.
1ый контур:
- CPU - 30.5+40=70.5 градусов
- GPU - 31.5+20 = 51.5 градусов
2ой контур:
- CPU - 30.90+40=70.90 градусов
- GPU - 31.55+20 = 51.55 градусов
А тут почему то проиграли... И как быть?

По идее жидкость проходящая через радиатор с большой скоростью будет чуть-чуть лучше охлаждаться, но эти расчеты я не знаю как произвести в замкнутом контуре. И всего скорее там будет от силы пару десятых градуса. Так что в любом исходе вся это возня с делением контура даст нам настолько малозаметные изменения, что лучше не изобретать велосипед. Так еще этот велосипед может сломаться в неожиданных местах(какие-нибудь завихрения в месте деления потока или один из рукавов будет забирать больше теплоносителя т.к. один из водоблоков забился и у второго будет "голодание").