Действие Aphelion разворачивается в мрачном будущем – к 2060 году Земля становится непригодной для жизни. Единственной надеждой человечества становится открытие 9-й планеты Солнечной системы под названием Персефона. Европейское космическое агентство отправляет научную миссию Hope 01, в составе которой два опытных астронавта – Ариана и Томас. Их задача: исследовать планету и определить, сможет ли человечество начать там новую жизнь.