Часовой пояс: UTC + 3 часа




Начать новую тему Новая тема / Ответить на тему Ответить  Сообщений: 26613 • Страница 1140 из 1331<  1 ... 1137  1138  1139  1140  1141  1142  1143 ... 1331  >
  Пред. тема | След. тема 
В случае проблем с отображением форума, отключите блокировщик рекламы
Автор Сообщение
 

TSC! Russia BOINC-manager
Статус: Не в сети
Регистрация: 19.01.2010
Откуда: Санкт-Петербург
Evgenii писал(а):
DmGun
"На сегодняшний день не существует способа предсказать даже структуру белка по его последовательности, тем более предсказать результат взаимодействия двух белков"
чет я не понял последней фразы по ссылке. А розетка с фолдингом тогда чем занимаются? Тем более, что в этой фразе говорится о белках, а ссылка стоит на новость о ДНК. Что-то журналист там напутал...


bronevik писал(а):
Фундаментальными исследованиями в этой области. Если б мы все понимали, они были бы не нужны.

Не помню где, слышал, как один наш доктор наук говорил об этом: "Мы приблизились к пониманию того, как летает фанерный биплан. Сложный белок это трансконтинентальный аэробус, а белок-белок это звездолет к гипердвигателем." Вопщем, keep on crunchin' :-)


Ну не так все ж запущено. Для F@H уже не представляет никакой сложности промоделировать(сворачивание и взаимодействие) короткие белки с высокой точностью. Розетта успешно (с приемлемой точностью) молотит и короткие и средние (кроме самых длинных) белки, взаимодейсвие тоже особых сложностей для нее уже не вызывает. Ее алогоритмами уже кучу исследователей из других лабаротарий и даже фарм-компаний пользуются для прикладных работ с белками.

Другое дело, что R@H на 1 единственный белок нужно от нескольких суток до нескольких недель работы РВ-сети или суперкомпьютера. F@H и вообще от неск. месяцев до года и более может 1 белок считать.
Так что такие методы к моделированию целых организмов, даже таких простых как простейшая бактерия описанная в статье - не подходят. Ибо даже в такой простейшей клетке 525 разных видов(не говоря уж сколько их в "штуках"/экземлярах) белков и черт знает сколько вариантов взаимодействия между ними(друг с другом) и белков с "простыми" веществами. Поэтому методами F@H и R@H даже примитивную бактерию не получится смоделировать.

А тут судя по краткому содержанию на английском, добились пусть и весьма упрощенного, но зато практически "realtime" моделирования жизни этой бактерии. Когда можно поменять какой-либо из параметров (скажем температуру окруж среди, добавить пит. веществ, или каких-то вредных для нее, включить/выключить какой-то ген в ДНК и т.д.) и сразу наблюдать как это сказывается на жизненном цикле клеток.
Как именно это реализовано - это надо полную статью читать (а она в закрытом - доступе, платная или по подписке на журнал). Но как понял это что-то типа статистически регрессионного анализа совокупности известных(из множества других исследований) биохимических зависимостей. Т.е. известно (из практики), что работа такого-то гена приводит с синтезу таких-то веществ, появление такого-то вещества в клетке в опредленной концентрации X, с опереденной задеркой Y приводит к повышению(или понижению) концентрации веществ Z1 и Z2 на Zx % и т.д. И вот созданная модель обрабатывает кучу таких известных зависимостей между 1900 разных параметров одновременно. Но без моделивания КАК это происходит.



Партнер
 

Advanced member
Статус: Не в сети
Регистрация: 26.08.2005
Откуда: 34
Не смотря на отпуск, сгонял на работу, запустил всё что простаивало.
P.S. С наступающим коллеги системные администраторы! :beer:


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 19.07.2010
Откуда: Казань
Да! С наступившим однако! :gamer3: :neo: :rtfm: :padonak: :girl_hospital: :bandhead: :shock: :D :beer:

_________________
RC64 (1997-1998); FaD (2005); F@H (2005-2006, 2011-...); S@H (2011-...); R@H (2011-...); WUProp (2012-...); Poem/Sat/Simap (2013-...)


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 13.12.2004
Откуда: Москва
Гуляем! :beer: :russian: :dance:

_________________
Помогите миру своим оверкомпом! tsc.overclockers.ru


 

Advanced member
Статус: Не в сети
Регистрация: 26.08.2005
Откуда: 34
Сегодня можно пить пиво, менять пароли и купаться в фонтанах без ограничений :beer: Главное не бить сотрудников правоохранительных органов из под root'а :oops:


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 08.09.2006
Откуда: Питер
С праздником господа! :beer:


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 04.12.2011
Откуда: Санкт-Петербург
Фото: 6
Всех СисАдминов с праздником. Сходил в Юлмарт, сдал материнку (ночью сдохла, я временно не считаю), поел пиццы и получил магнит на выходе :-)

_________________
Это Питер, детка =)


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 24.04.2011
Откуда: Москва
Mad'Max собственно метафорически тот доктор об этом и говорил. В общих чертах ясно: движок дает тягу, вот такой профиль крыла в набегающем потоке создает подъемную силу, дергаешь вот за эти ручки, он поворачивает вправо-влево. Но до глубокого понимания всех задействованных при этом систем (а их не одна тысяча) ещё очень долго. Да, можно взять один небольшой белочек и за пару месяцев посмотреть, как он свернется. Можно прогнать его по сложным физическим моделям и как-то пролить свет, зачем он в организме нужен. Но где там понять как работает клетка мозга, в которой таких белков тысячи.

Всех тружеников с праздничком! :beer:


 

TSC! Russia Vice-captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 21.03.2006
Откуда: Петербург
С днём военно-морского флота!
Ура!!!

_________________
Революционеров можно убить, идеи — никогда.


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 10.09.2008
Откуда: Москва
Ура!!!

_________________
http://boincstats.com/signature/-1/user/98728/project/sig.png


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 09.10.2011
Откуда: Владивосток
Эн Таро Адун! :beer:


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 12.06.2004
Откуда: HoBocu6upck
привет :)

_________________
http://valid.canardpc.com/cache/banner/428601.png


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 23.07.2006
Откуда: Krasnoyarsk
Ссори за рассылку ребят)). Я типа не ожидал, что обычное л.с разлетится по целой группе). Просто человеку ответил как обычно).

Добавлено спустя 14 минут 43 секунды:
Хаха... :lol: Вы чего напали-то на меня... давайте [встал в стойку] я со всеми готов смахнуться)))).... идите сюда))), кто старший тут!?... Ну косяк, чего теперь))...

_________________
Я прирождённый кузнец, я не могу ни куя! ©


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 04.12.2011
Откуда: Санкт-Петербург
Фото: 6
RUMPELSHTICTIK теперь тем же методом рассылки извиняйся за спам :writer:

_________________
Это Питер, детка =)


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 02.02.2010
Откуда: Пермь
Главное, чтобы этих "косяков" меньше было. Еще начнут выходить из группы по этой причине. Может предложить (исправить ошибку?) администратору оставить такие права только у наших модераторов?

_________________
Распределенные вычисления - http://tscrussiateam.ru/
Форум нашей команды - http://forums.overclockers.ru/viewforum.php?f=21


 

TSC! Russia Vice-captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 21.03.2006
Откуда: Петербург
noname2
У меня в почтовый ящик каждую неделю накидывают по 10-12 всяких дурных рекламных листовок. Что-то не припоминаю, чтобы кто-то из-за этого снимал почтовый ящик или съезжал из дома.

_________________
Революционеров можно убить, идеи — никогда.


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 02.02.2010
Откуда: Пермь
Всё равно вижу мало смысла в подобной возможности для абсолютно всех участников. С праздниками поздравлять? Хотя адекватный человек едва ли понапишет лишнего всей группе.

_________________
Распределенные вычисления - http://tscrussiateam.ru/
Форум нашей команды - http://forums.overclockers.ru/viewforum.php?f=21


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 05.05.2006
Откуда: без дома
:D Привет, ребята! Как вы тут поживаете? Считаете? Давайте, я за вас всеми руками (двумя, кажется)! :super:

_________________
В душе моей гармония и спокойствие.


 

TSC! Russia member
Статус: Не в сети
Регистрация: 14.01.2011
Откуда: Волгоград
Фото: 105
Тиночка Привет! :D Считаем, куда же мы денемся. Хорошо, что зашла. :-)

_________________
Команда TSC! Russia:
http://tscrussiateam.ru
http://forums.overclockers.ru/viewforum.php?f=21


 

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 05.05.2006
Откуда: без дома
Да, вот рассылку, случайную, получила и решила написать. У меня все потихонечку, сейчас в Мытищах живу :-)

_________________
В душе моей гармония и спокойствие.


Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Новая тема / Ответить на тему Ответить  Сообщений: 26613 • Страница 1140 из 1331<  1 ... 1137  1138  1139  1140  1141  1142  1143 ... 1331  >
-

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 10


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Перейти:  
Создано на основе phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB | Kolobok smiles © Aiwan