TSC! Russia BOINC-manager
Статус: Не в сети Регистрация: 19.01.2010 Откуда: Санкт-Петербург
Evgenii писал(а):
DmGun "На сегодняшний день не существует способа предсказать даже структуру белка по его последовательности, тем более предсказать результат взаимодействия двух белков" чет я не понял последней фразы по ссылке. А розетка с фолдингом тогда чем занимаются? Тем более, что в этой фразе говорится о белках, а ссылка стоит на новость о ДНК. Что-то журналист там напутал...
bronevik писал(а):
Фундаментальными исследованиями в этой области. Если б мы все понимали, они были бы не нужны.
Не помню где, слышал, как один наш доктор наук говорил об этом: "Мы приблизились к пониманию того, как летает фанерный биплан. Сложный белок это трансконтинентальный аэробус, а белок-белок это звездолет к гипердвигателем." Вопщем, keep on crunchin'
Ну не так все ж запущено. Для F@H уже не представляет никакой сложности промоделировать(сворачивание и взаимодействие) короткие белки с высокой точностью. Розетта успешно (с приемлемой точностью) молотит и короткие и средние (кроме самых длинных) белки, взаимодейсвие тоже особых сложностей для нее уже не вызывает. Ее алогоритмами уже кучу исследователей из других лабаротарий и даже фарм-компаний пользуются для прикладных работ с белками.
Другое дело, что R@H на 1 единственный белок нужно от нескольких суток до нескольких недель работы РВ-сети или суперкомпьютера. F@H и вообще от неск. месяцев до года и более может 1 белок считать. Так что такие методы к моделированию целых организмов, даже таких простых как простейшая бактерия описанная в статье - не подходят. Ибо даже в такой простейшей клетке 525 разных видов(не говоря уж сколько их в "штуках"/экземлярах) белков и черт знает сколько вариантов взаимодействия между ними(друг с другом) и белков с "простыми" веществами. Поэтому методами F@H и R@H даже примитивную бактерию не получится смоделировать.
А тут судя по краткому содержанию на английском, добились пусть и весьма упрощенного, но зато практически "realtime" моделирования жизни этой бактерии. Когда можно поменять какой-либо из параметров (скажем температуру окруж среди, добавить пит. веществ, или каких-то вредных для нее, включить/выключить какой-то ген в ДНК и т.д.) и сразу наблюдать как это сказывается на жизненном цикле клеток. Как именно это реализовано - это надо полную статью читать (а она в закрытом - доступе, платная или по подписке на журнал). Но как понял это что-то типа статистически регрессионного анализа совокупности известных(из множества других исследований) биохимических зависимостей. Т.е. известно (из практики), что работа такого-то гена приводит с синтезу таких-то веществ, появление такого-то вещества в клетке в опредленной концентрации X, с опереденной задеркой Y приводит к повышению(или понижению) концентрации веществ Z1 и Z2 на Zx % и т.д. И вот созданная модель обрабатывает кучу таких известных зависимостей между 1900 разных параметров одновременно. Но без моделивания КАК это происходит.
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 24.04.2011 Откуда: Москва
Mad'Max собственно метафорически тот доктор об этом и говорил. В общих чертах ясно: движок дает тягу, вот такой профиль крыла в набегающем потоке создает подъемную силу, дергаешь вот за эти ручки, он поворачивает вправо-влево. Но до глубокого понимания всех задействованных при этом систем (а их не одна тысяча) ещё очень долго. Да, можно взять один небольшой белочек и за пару месяцев посмотреть, как он свернется. Можно прогнать его по сложным физическим моделям и как-то пролить свет, зачем он в организме нужен. Но где там понять как работает клетка мозга, в которой таких белков тысячи.
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 23.07.2006 Откуда: Krasnoyarsk
Ссори за рассылку ребят)). Я типа не ожидал, что обычное л.с разлетится по целой группе). Просто человеку ответил как обычно).
Добавлено спустя 14 минут 43 секунды: Хаха... Вы чего напали-то на меня... давайте [встал в стойку] я со всеми готов смахнуться)))).... идите сюда))), кто старший тут!?... Ну косяк, чего теперь))...
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 02.02.2010 Откуда: Пермь
Главное, чтобы этих "косяков" меньше было. Еще начнут выходить из группы по этой причине. Может предложить (исправить ошибку?) администратору оставить такие права только у наших модераторов?
_________________ Распределенные вычисления - http://tscrussiateam.ru/ Форум нашей команды - http://forums.overclockers.ru/viewforum.php?f=21
TSC! Russia Vice-captain
Статус: Не в сети Регистрация: 21.03.2006 Откуда: Петербург
noname2 У меня в почтовый ящик каждую неделю накидывают по 10-12 всяких дурных рекламных листовок. Что-то не припоминаю, чтобы кто-то из-за этого снимал почтовый ящик или съезжал из дома.
_________________ Революционеров можно убить, идеи — никогда.
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 02.02.2010 Откуда: Пермь
Всё равно вижу мало смысла в подобной возможности для абсолютно всех участников. С праздниками поздравлять? Хотя адекватный человек едва ли понапишет лишнего всей группе.
_________________ Распределенные вычисления - http://tscrussiateam.ru/ Форум нашей команды - http://forums.overclockers.ru/viewforum.php?f=21
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 10
Вы не можете начинать темы Вы не можете отвечать на сообщения Вы не можете редактировать свои сообщения Вы не можете удалять свои сообщения Вы не можете добавлять вложения