короче я, наверное, перестану считать

There are a lot of people out there exploring protein folding using first principles. You just have to look at the Folding@Home work to see both what can be done and what can't be done in this area. Clearly these guys don't really care about CASP. That's fair enough - they are quite happy folding the villin headpiece over and over again and learning something about the early stages of protein folding in the process - good luck to them.

I have to admit that I would certainly be interested in seeing what Vijay Pande's group could actually do with a small CASP target. I think it's important to know how far we can currently go with the best classical force fields, molecular dynamics and 200,000 CPUs! I think we should really try to interest him in getting involved, but he probably can't see any advantages in doing so. Maybe someone else could take the Folding@Home software (or a close approximation of it) and run it on some small CASP targets? This is data that I really would like to see.

а вот как идет начисление каких-то очкив?

Можно попробовать переименовать файл консоли, ругнулся он именно на нее. Было бы желание...

Можно ли это как-нибудь сделать без использования фаирволла ? ( тока без : поставь фаирволл плз)) )

NVIDIA мечтает заменить кластеры своими GPU, а начинает с Folding@Home

BlackCat @ 00:51

PR-менеджер NVIDIA в северной Европе Адам Фоат сообщил о том, что компания работает со многими научными организациями, включая Стэнфордский университет (создатели проекта Folding@Home) и рассчитывает, что уже в следующем году её ускорители помогут самым разным исследовательским программам.

Распределенные вычисления обретают всё большую популярность, позволяя заинтересованным организациям привлечь к ним мощь простаивающих существенное время компьютеров пользователей, подключенных к Сети. Самым известным из таких проектов является Folding@Home. Он взял свое начало в 2000 году. Цель проекта - с помощью моделирования процессов свертывания/развёртывания молекул белка получить лучшее понимание причин возникновения болезней, вызываемых дефектными белками, таких как болезнь Альцгеймера, Паркинсона, диабет типа II, коровье бешенство и склероз. К настоящему времени проект Folding@Home успешно смоделировал процесс свёртки белковых молекул на протяжении 5-10 микросекунд - что в тысячи раз больше предыдущих попыток моделирования.

Виджей Панде, руководитель проекта Folding@Home, рассказал, что изначально клиентская программа для графических процессоров писалась как раз в расчёте на GPU NVIDIA, однако выход на рынок эффективного в таких вычислениях ATI X1900 заставил учёных из Стэнфорда пересмотреть приоритеты. Сейчас, после поступления в продажу видеокарт на базе G80 в код будут внесены некоторые изменения, которые позволят задействовать мощь нового процессора NVIDIA.

Дальнейшие планы калифорнийского разработчика и производителя еще более амбициозны. Фоат рассказал, что NVIDIA рассчитывает на применение своих ускорителей в серьезных коммерческих проектах, где на смену кластерам придут системы с 1-4 видеоакселераторами.

В качестве возможных сфер применения GPU называются обработка сигналов диагностического медицинского оборудования, электромагнетическая симуляция, биоинформационные разработки, анализ баз данных. Вытеснить CPU графические процессоры не смогут в силу более узкой своей специализации, однако заметную долю рынка вычислений, поддающихся распараллеливанию и чувствительных к скорости подсистемы памяти, занять способны, верит NVIDIA.