Здравствуйте уважаемые счетоводы!
Простите, если мой вопрос не в той теме.
А вопрос такой: часто замечаю, что кусок полипептидной цепи в окне просмотра (обычный треевый CPU клиент) имеет разрывы. Ну, или своего рода молекулы-"спутники".
Достаточно странно для белковой молекулы, т.к. её первичная структура (насколько я понял, кусочек её и даётся в качестве задания) имеет вид последовательности аминокислот без всяких промежутков, естественно.
Может кто просвятит?
Заранее спасибо.
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 09.07.2008 Откуда: Золотая миля.
mrVodyanoi Красивая картинка - не более, чем антураж. Кроме отвлечения ресурсов - никакого практического смысла не имеет. Не говоря уж там о разрывах в полипептидных цепях. Забей.
Тогда по меньшей мере странно, что вместо реальных результатов расчета конфигурации, показывается "мультик". Тогда что же реально считается? Я понимаю, что "никто никого тут не принуждает"... Но неужели никто и не задумывается, что там действительно считается?
Извините, если обидел.
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 09.07.2008 Откуда: Золотая миля.
mrVodyanoi Мультик не мультик, но научной ценности не представляет. Настоящий результат содержится в файле, который отсылается на аккумулирующие сервера докторов. Реально в одном задании моделируется неск. наносекунд процесса пространственного свёртывания участка какого-то белка в какой-то среде. Насчёт того, что там считается давным-давно все копья сломаны. Это открытый мировой проект и задействованы огромные ресурсы. В том числе материальные.
_________________ Так-то оно так, потому как не может того быть, кабы не было бы никак. И не потому, что оно вообще, а потому, что когда оно что, тогда оно и пожалуйста
Ну, тут значится, несколько вариантов (всё - ИМХО):
1. Мультик показывает откровенную ерунду лишь для того, чтобы пользователя вдохновлять. Больше похоже на правду - поскольку с таким маленьким кусочком молекулы, который вертится на экране, не то что третичную структуру не посчитаешь (там на конформацию всё-таки влияют участки цепи, расположенные в сотнях-тысячах звеньев друг от друга), но и вторичную точно рассчитать с болтащимися рядом "кусочками" сложновато.
2. Разработчики системы создали чудо-алгоритм котрый позволяет раскромсать в произвольном (это слово ключевое - иначе, откуда "кусочки"?) порядке белковую молекулу, огрызки обработать усилиями удаленных машин и соединить всё в готовую картину, учитывая при этом вляние сразу всех огрызков друг на друга. Интересно, что за суперкомп считает укладку третичной и четвертичной структур?
3. Я глуп и мне не понять таких сложных материй
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 09.07.2008 Откуда: Золотая миля.
mrVodyanoi писал(а):
Ну, тут значится, несколько вариантов (всё - ИМХО): 1. Мультик показывает откровенную ерунду лишь для того, чтобы пользователя вдохновлять. Больше похоже на правду - поскольку с таким маленьким кусочком молекулы, который вертится на экране, не то что третичную структуру не посчитаешь (там на конформацию всё-таки влияют участки цепи, расположенные в сотнях-тысячах звеньев друг от друга), но и вторичную точно рассчитать с болтащимися рядом "кусочками" сложновато. 2. Разработчики системы создали чудо-алгоритм котрый позволяет раскромсать в произвольном (это слово ключевое - иначе, откуда "кусочки"?) порядке белковую молекулу, огрызки обработать усилиями удаленных машин и соединить всё в готовую картину, учитывая при этом вляние сразу всех огрызков друг на друга. Интересно, что за суперкомп считает укладку третичной и четвертичной структур? 3. Я глуп и мне не понять таких сложных материй
Уважаемый mrVodyanoi, я не собираюсь вдаваться в бесполезное истирание клавиатуры.
1. Если Вы так умны, то почему Вы задаёте такие глупые вопросы. Идите к первоисточнику, там ищите ответы и что-то доказывайте
2. Если Вы, следуя Вашему пункту №3, глупы, то к чему всё это вообще?.
Member
Статус: Не в сети Регистрация: 13.05.2006 Откуда: Питер
BehcЯ для начала хочу понять,что человек хочет,но наверное я ещё не дорос и не понимаю чего же все таки. Ну а если человек не понимает,что мы все тут занимаемся благотворительностью и оказываем помощь фундаментальной науке изучающей достаточно конкретный вопрос-крыть нечем. Ну уж точно не ради мультика считаем.
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 2
Вы не можете начинать темы Вы не можете отвечать на сообщения Вы не можете редактировать свои сообщения Вы не можете удалять свои сообщения Вы не можете добавлять вложения