Обсуждаем проект Folding@Home.
Номер нашей команды: 47191
Страница регистрации в проекте F@H: https://apps.foldingathome.org/getpasskey Обязательна для получения бонусных очков
По вопросам работы универсального клиента обращайтесь в соответствующие ветки:
Универсальный (SMP+GPU) клиент v.7
Folding@Home под Linux
Статистика заданий и рекорды команды: [F@H] Статистика заданий
В этой ветке все о мониторинге клиента FAH http://forums.overclockers.ru/viewtopic ... 1&t=122378
Статусы основных серверов F@h: https://apps.foldingathome.org/serverstats
Список текущих проектов: https://apps.foldingathome.org/psummary?visibility=ALL
Статистика команды на сайте extremeoverclocking.com: https://folding.extremeoverclocking.com ... s=&t=47191
Статистика по общему количеству CPU\GPU, мощности проекта: https://stats.foldingathome.org/os
Статистика по отдельным картам и процессорам в проекте: https://folding.lar.systems/gpu_ppd/overall_ranks
Официальный форум проекта: https://foldingforum.org
Мы в Telegram - https://t.me/TSCRussia

буду мочить


Добавлено спустя 6 минут 6 секунд:
добавил ключ -advmethods нечисть исчезла.

Это ответ накурившихся разработчиков громакса на моденые яйца неужелиж до сих пор не поняли? Как раз год прошел

6a3apoB яйца тут не причем,у меня все пасхальные-а вот эта муйня

все 6 жаб прибывших сегодня отдыхают в корзине.Жаль конечно,если они нужны для науки. Слово надо держать.Война так война.

Добавлено спустя 28 минут 45 секунд:
действительно Голандцы шалят и чем им русские насолили-ПетраI забыть не могут

http://distributed.ru/forum/?a=topic&topic=1111

В начале своей работы проект распределенных вычислений Folding@home, созданный специально для поиска решения проблемы фолдинга (сворачивания белка из линейной последовательности аминокислот в сложную трехмерную глобулу), ставил перед собой в 1000 раз более скромную задачу: смоделировать хотя бы одну микросекунду этого процесса.

Тысячекратное увеличение времени моделирования фолдинга – огромный шаг вперед. И не с точки зрения чистой науки: неправильное сворачивание белков, которое является причиной многочисленных заболеваний, включая рак и болезнь Альцгеймера, происходит в течение относительно длительных промежутков времени. Детальное, с точностью до атома, моделирование этого процесса поможет в разработке препаратов для профилактики и лечения множества болезней.

Группе учёных из Стэнфорда, координирующим проект Folding@home, удалось преодолеть микросекундный барьер благодаря разработке нового метода разделения задач между процессорами – модели состояний Маркова (Markov State Model, MSM).

В приведенном ниже видеоролике показан один из путей сворачивания молекулы одного из белков большой субъединицы рибосомы – NTL9. Этот белок стал первым потому, что в норме его фолдинг происходит очень медленно (для молекулярных процессов). На ролике эти полторы миллисекунды растянуты почти на полторы минуты.

Модель сворачивания белка NTL9 в миллисекундном временном масштабе представлена в видео-ролике на YouTube: http://www.youtube.com/watch?v=gFcp2Xpd29I
Ниже приводится расшифровка происходящего на экране:
Начальный момент: молекула в развёрнутом состоянии.
Спираль вторичной структуры образуется очень быстро,
остальная часть молекулы остаётся в развёрнутом состоянии.
Гидрофобный коллапс.
Бета-структура (структура складчатого листа) совершает мерцательные движения,
формируется N-терминальная бета-шпилька,
но попадает в ловушку – в «неродное» состояние.
несвойственный контакт разрушается
Образуется фрагмент с чистой вторичной структурой.
Не хватает третьей части листа.
Внимание: смотрим на С-терминальую часть!
С-терминальная часть сдвигается на место…
(повтор: снова обратите внимание на С-терминальную часть!)
...и замыкается с помощью водородных связей и боковых цепей
с образованием скрученной структуры.
Фолдинг завершён!

Результаты работы опубликованы в Journal of the American Chemical Society: Vincent A. Voelz et al., Molecular Simulation of ab Initio Protein Folding for a Millisecond Folder NTL9(1−39).

Данная методика может быть успешно применена для моделирования и в более длительных промежутках времени. Сейчас учёные работают над дальнейшим совершенствованием своего метода и его применением для изучения более сложных белков, а также для проверки многочисленных экспериментальных данных. Авторы новой модели уже воспользовались своим методом для изучения нарушения сворачивания белков при болезни Альцгеймера. Хотя более ранние модели охватывают достаточно широкие временные рамки и позволяют изучать олигомерные фрагменты с небольшим молекулярным весом, новая методика обещает продвинуться дальше в моделировании болезни Альцгеймера и установить детали фолдинга более сложных олигомеров бета-амилоида, чем было возможно ранее.

Новая разработка в области моделирования процессов сворачивания белков – очень вдохновляющее достижение для учёных, и они полны оптимизма искать новые применения этой технологии.

Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru по материалам Folding@Home: Molecular Simulation of ab initio Protein Folding for a Millisecond Folder

Lendy прикольно дергается белок,вот как это реально представить себе 1 миллисекунду

Доктора опять жгут: из проекта исчезли почти все gpu жабы и big за одно

anubias
думаю в реальности он не должен так дергаться. ИМХО. Думаю это погрешность метода, ориентированного на поиск конечного состояния.

Кто подскажет, как это вылечить?
exceeds packet limit set (5241856)

Как перенаправить запросы с компьютера с одного ip на другой ip. Через командную строку route? Я разобраться не могу.

ket[CHUP]
Задачу озвучь.

попросить докторов подключить сервера. Новость вчерашняя http://folding.typepad.com/news/2010/01/index.html

Это я, стало быть, во время счета поменял... Ща попробую...

targitaj
Перенаправить все запросы с 171.64.122.70, на 171.67.108.11. 171.64.122.70 - заблокировал кто то в прокси, а до прокси не добратся до след недели

Добавлено спустя 11 минут 57 секунд:
Помогите уже 2 час бьется а толку 0

ket[CHUP]
Ты хочешь получить или отправить? Если получить, то просто измени настройки клиента. Тип там или бигпакетс.

А уже посчитанные и не отправленные жабы не слетят от изменения настроек?
P.s И все же можно реализовать перенаправление или забросить эту идею?

ket[CHUP]
Дедлайн терпит?

Дедлаин да, я вечером отправлю через знакомого. Просто жалко что клиент простаивает. Уперся рогом в 171.64.122.70 и не хочет на другой пересесть.

Добавлено спустя 2 минуты 34 секунды:
Мне уже просто интересно стало как перенаправить запрос

В общем, не победил. Удалил около 8 результатов... Надо им будет - исправят эту "фичу".

они что издеваются, изменил параметры меня все равно на 171.64.122.70 кидают. Шизофрения...
Кто разбирается в маршрутизации помогите.

что ж ты раньше молчал, "хоть бы записку оставил, когда вешался"(ц)