Часовой пояс: UTC + 3 часа




Начать новую тему Новая тема / Эта тема закрыта, вы не можете редактировать и оставлять сообщения в ней. Закрыто  Сообщений: 28 • Страница 2 из 2<  1  2
  Пред. тема | След. тема 
В случае проблем с отображением форума, отключите блокировщик рекламы
Автор Сообщение
 
Прилепленное (важное) сообщение

Member
Статус: Не в сети
Регистрация: 11.03.2008
Откуда: Yoburg
Тема предназначена для публикации новостей о проекте Rosetta@Home.
Оф. сайт: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
Комментарии к новостям - только в порядке дополнения или исправления ошибок. Все другие обсуждения - в соответствующих темах форума.


Последний раз редактировалось MegaCalcii 13.04.2020 6:02, всего редактировалось 28 раз(а).
[Rosetta@Home] Новости | Помогите в борьбе с COVID-19!



Партнер
 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
04.01.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Новая публикация в Nature: программируемые гетеродимеры
#77
Недавно в Nature был опубликован новый отчет, описывающий дизайн белков, имитирующих ДНК.

Используя вычислительный дизайн, были созданы гетеродимерные белки, которые образуют двойные спирали со специфичностью, опосредованной водородными связями. Когда группа этих новых белковых молний расплавляется и затем перезаряжается, образуются только правильные пары. Они все взаимно-ортогональны. С этими новыми инструментами будет возможно сконструировать большие основанные на белке машины, которые будут самостоятельно собираться предсказуемым образом.

Прочитать полный текст статьи можно здесь: https://www.nature.com/articles/s41586-018-0802-y (PDF)

Мы хотели бы поблагодарить всех добровольцев Rosetta@home, которые предоставили вычислительные ресурсы, использованные в этой работе. Спасибо!

04.01.2019 г.
Admin сайта писал(а):
#77
Читатели Nature's News & Views выбрали статью о нашей работе как «Выбор читателей 2018 года»!

В статье, написанной Roberto Chica из Университета Оттавы, проделывается фантастическая работа, детализируя нашу недавнюю публикацию о флуоресцентно-активирующихся белках "с нуля"- и о проблемах дизайна белка "с нуля" в целом.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
14.01.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Еще одна публикация в Nature, описывающая первые разработанные белки с противораковой активностью "с нуля".
#77
На прошлой неделе в журнале Nature был опубликован отчет о первых разработанных белках с противораковой активностью "с нуля".

Эти компактные молекулы были разработаны для стимуляции тех же рецепторов, что и IL-2, мощным иммунотерапевтическим лекарственным средством, избегая при этом нежелательных взаимодействий с рецепторами вне мишени. Мы считаем, что это только первое из многих компьютерных лекарств от рака, обладающих повышенной выборочностью и эффективностью.

Участники R@H предоставили вычисления для экспериментов по сворачиванию в прямом направлении, использованные в этом исследовании, что помогло проверить правильность дизайна. Мы хотели бы поздравить и поблагодарить всех добровольцев R@H, которые внесли свой вклад в эту работу! Спасибо!

Полную статью можно прочитать здесь: https://www.nature.com/articles/s41586-018-0830-7(PDF)

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
08.03.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Первая вакцина из наночастиц от ИДБ(Институт дизайна белков)
#77

Исследователи из лаборатории Кинга, аффилированного с Институтом дизайна белка, опубликовали отчет в «Cell» о компьютерной точечной вакцине из наночастиц, предназначенной для респираторно-синцитиального вируса (RSV). Хотя Rosetta@Home не использовалась напрямую для этого исследования, волонтеры Rosetta@Home предоставили компьютерные технологии для соответствующих исследований и разработок.

Из новостей ИДБ:
Миллионы детей посетят больницы в этом году, заболевшие RSV (*1). Инфекция обычно легкая, вызывает только лихорадку, насморк и испуганных родителей. Но в тяжелых случаях сильный кашель и болезненное хрипение могут указывать на серьезные респираторные осложнения, включая бронхиолит и пневмонию. RSV является основной причиной пневмонии у детей в возрасте до одного года и поэтому является основной причиной детской смертности во всем мире после малярии. Хотя практически каждый ребенок на Земле получает RSV в возрасте до трех лет, по оценкам, 99 процентов случаев смертей от RSV происходят в развивающихся странах. Несмотря на значительные усилия, пока нет безопасной и эффективной вакцины.

Сегодня международная команда ученых под руководством исследователей из ИДБ в отчете Cell впервые в своем роде является вакциной-кандидатом на RSV. Он вырабатывает широко нейтрализующие антитела против респираторно-синцитиального вируса у мышей и обезьян, прокладывая путь для клинических испытаний на людях.

*1 Респираторно-синцитиальный вирус (RSV) - вид вирусов, вызывающий инфекции дыхательных путей. Является основной причиной инфекций нижних дыхательных путей у новорожденных и детей.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
06.06.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Гражданские ученые используют Foldit для успешного создания синтетических белков
#77
#77
Гражданские ученые теперь могут использовать Foldit для успешного создания синтетических белков. Первоначальные результаты этого уникального сотрудничества описаны в "Nature".

Эти компактные молекулы были разработаны для стимуляции тех же рецепторов, что и IL-2, мощным иммунотерапевтическим лекарственным средством, избегая при этом нежелательных взаимодействий с рецепторами вне мишени. Мы считаем, что это только первое из многих компьютерных лекарств от рака, обладающих повышенной выборочностью и эффективностью.

Участники R@H предоставили вычисления для экспериментов по сворачиванию в прямом направлении, использованные в этом исследовании, что помогло проверить правильность дизайна. Мы хотели бы поздравить и поблагодарить всех добровольцев R@H, которые внесли свой вклад в эту работу! Спасибо!

Полную статью можно прочитать здесь: https://www.nature.com/articles/s41586-018-0830-7(PDF)

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
15.07.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Белковые массивы на минеральных поверхностях
#77
На прошлой неделе Лаборатория Бейкер в сотрудничестве с лабораторией Де Йорео в PNNL опубликовала в Nature отчет, в котором описывается конструкция массивов синтетических белков, которые собираются на поверхности слюды, распространенного и исключительно гладкого кристаллического минерала. Эта работа обеспечивает основу для понимания того, как кристаллические взаимодействия могут быть систематически запрограммированы. Хотя R@H не использовался непосредственно для этого исследования, ранее спроектированные субъединицы были проверены с использованием R@H. Поздравляем всех волонтеров R@H и благодарим за ваш постоянный вклад.

Чтобы узнать подробности, нажмите здесь.

15.07.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Коэволюция в масштабе протеома
#77
На прошлой неделе в журнале Science был опубликован отчет, описывающий выявление сотен ранее нехарактеризованных белок-белковых взаимодействий кишечной палочки и патогенной бактерии палочки Коха. К ним относятся как ранее неизвестные белковые комплексы, так и ранее не охарактеризованные компоненты известных комплексов. Это исследование было проведено после защиты докторской сотрудником Qian Cong и бывшего аспиранта лаборатории Бейкер Сергея Овчинникова, в настоящее время выдающегося научного сотрудника стипендиата имени Джона Гарварда в Гарварде. Rosetta@Home использовалась для большинства вычислений, необходимых для этой работы. Поздравляю и благодарю всех добровольцев R@H. Для получения дополнительной информации об этой работе нажмите здесь.


16.07.2019 г.
Admin сайта писал(а):
Дерзкий Проект
Вложение:
audacious_rus.png
audacious_rus.png [ 123.77 КБ | Просмотров: 1077 ]

Как вы, возможно, слышали, Институт дизайна белка был недавно выбран в рамках Дерзкого Проекта. Это масштабное благотворительное сотрудничество, являющееся преемником премии TED, охватывающее и финансирующее проекты, способные изменить мир.

В результате мы расширяем нашу команду ученых и инженеров из Сиэтла, которые будут совместно работать над продвижением Rosetta, нашего программного обеспечения для проектирования белков и прогнозирования структуры. Финансирование также позволит нам инвестировать в оборудование, расходные материалы и лабораторные помещения, необходимые для разработки и тестирования миллионов синтетических белков.

Какие вызовы мы будем решать? Смотрите мой разговор на TED, чтобы это узнать.
Видео с YouTube с русскими субтитрами

Вся эта работа, как и все, что мы делаем, будет зависеть от вас, участников Rosetta@Home. Будь то создание нестандартных наноматериалов или безопасное лечение рака, мы полагаемся на платформу распределенных вычислений Rosetta@Home. Мы не можем отблагодарить вас за то, что вы нашли время участвовать в этом захватывающем исследовании, и мы надеемся, что вы скажете хотя бы одному другу, что они тоже могут сыграть свою роль в революции в разработке белков, просто запустив Rosetta@Home.

Спасибо,

Дэвид Бейкер
Директор Института Дизайна Белков.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
24.02.2020 г.
Admin сайта писал(а):
Роль Rosetta в борьбе с коронавирусом
#77
Спасибо всем добровольцам R@H за ваш вклад в точное моделирование важных белков коронавируса. Коллективные вычислительные мощности, которые вы предоставляете через R@H, помогают академическим исследовательским группам по всему миру моделировать важные структуры белка, подобные этим.
Из недавнего новостного сообщения IPD:
«Мы рады сообщить, что набор молекулярного моделирования Rosetta недавно использовался для точного прогнозирования структуры важного белка коронавируса в атомном масштабе за несколько недель до того, как его можно было измерить в лаборатории. В настоящее время знания, полученные при изучении этого вирусного белка, используются для руководства по разработке новых вакцин и противовирусных препаратов». С момента выпуска последовательностей генома SARS-CoV-2 в конце января, ряд важных белков коронавируса, таких как описанный выше, был смоделирован на компьютерах добровольцев R@H. Список этих белков предоставлен Сиэтлским центром структурной геномики по инфекционным заболеваниям (SSGCID)

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
19.03.2020 г.
Admin сайта писал(а):
Разработка белков, с изменяющейся формой
#77
Спасибо всем участникам R@H, которые предоставили большую часть вычислений, использованных в недавнем исследовании, опубликованном в PNAS, описывающем конструирование белков, которые принимают более одной хорошо сложенной структуры, напоминающей вирусные слитые белки.
Для получения дополнительной информации, нажмите здесь.


03.04.2020 г.
Admin сайта писал(а):
Помогите в борьбе с COVID-19!
#77
В связи с недавней вспышкой COVID-19 R@H использовался для прогнозирования структуры белков, важных для заболевания, а также для производства новых стабильных мини-белков, которые можно использовать в качестве потенциальной терапии и диагностики, таких как показанный выше, который связан с частью белка шипа COVID-19.

 Чтобы помочь нашим исследованиям, мы рады объявить о новом обновлении приложения, и благодаря помощи сообщества разработчиков Arm, в том числе Rex St. John, Дмитрия Москальчука, David Tischler, Lloyd Watts и Sahaj Sarup, мы рады включению Linux-ARM платформ. С этим обновлением мы продолжим делать белковые связующие для COVID-19 и связанные цели, используя последнюю версию Розетты.

 Спасибо волонтерам R@H за постоянную поддержку этого проекта. Часы вашего процессора используются не только для точного моделирования структур важных белков, но и для разработки новых. Давайте объединяться и бороться с COVID-19! Более подробная информация будет доступна в обсуждении этой новости.

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


 

TSC! Russia Captain
Статус: Не в сети
Регистрация: 16.08.2007
Откуда: Красноярск
01.05.2020 г.
Admin сайта писал(а):
Переход на использование SSL (уровень защищенных "соединений").

Мы обновили наш проект для использования SSL. Таким образом, URL проекта был изменен на https://boinc.bakerlab.org/rosetta. Вы можете переподключить проект, используя этот обновленный URL, в любое удобное для вас время. Пожалуйста, сообщайте о любых проблемах, связанных с этим обновлением, в теме обсуждения.

26.06.2020 г.
Твиттер писал(а):
У нас есть несколько БОЛЬШИХ НОВОСТЕЙ: Исследователи Института Дизайна Белков
преуспели в создании противовирусных белков, которые нейтрализуют новый коронавирус в лаборатории. (Сейчас эти экспериментальные препараты оптимизируются для испытаний на животных).

Спасибо за помощь!

#77

_________________
У тебя мощнейший комп, ты уверен? И для чего он тебе? В TSC! Russia ты узнаешь что такое мощь тысячи компов! TSCRussiaTeam.ru


Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Новая тема / Эта тема закрыта, вы не можете редактировать и оставлять сообщения в ней. Закрыто  Сообщений: 28 • Страница 2 из 2<  1  2
-

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 6


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Перейти:  



Лаборатория














Создано на основе phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB | Kolobok smiles © Aiwan