отписываюсь о проделанной работе.
Действительно на моей матери есть пару вилок sata на контроллере silicon image sil, но в режиме normal без raid может функционировать только один порт, если воткнуть два, то второй hdd не видится системой, а жаль((( в raid естественно все работает. Ну да ладно, воткнул seagate 3тб на silicon image, копирование на него летит влет, еще и скорость 120-140мб\с . Втыкаю второй диск Toshiba на 3тб на порт, за который отвечает чипсетный интеловский контроллер, скачиваю windows 10 PE от сентября 2016 года и гружусь с него. Идет копирование, едрёна мать))))), но очень все забавно, скорость гуляет, падает до нуля, стоит в ноле минуту, опять начинает копирование, потом с нова в ноль и через пару минут копирование восстанавливается на скорости 60-80мб\с и уже не падает. Я такого поведения вообще не видел. Снова гружусь на рабочую винду, копирования на этот жесткий диск нет, скорость падает до нуля и уже не восстанавливается, виснет проводник, ресет. Если же копировать с него, то все пучком. Сношу нахрен рабочую винду(копию сохранил акронисом), ставлю по новой билд 1607. Драйвера виндовские, проблема с копированием остается, драйвера интел, проблема остается. Снова гружусь на windows PE, все работает в таком же режиме, что описал выше. Вздутых кондеров не нашел, радиатор на севернике и южнике на месте и совсем не горячие, в биосе поднял чуть напругу на южнике, результатов не дало. Ради интереса, переконвертировал другой нормально работающий жесткий(seagate на 750гб) в GPT, проблемы нет. Остается проверить другой, более ранний билд системы, больше мыслей нет. Повторюсь, раньше такой проблемы не было, может так совпало конечно, но началось все с обновлением системы на 1607 билд. Переключившись на ide режим в биосе, все проблемы нивелируются, скорость только дохлая и трим на ssd не работает.