Я бы рекомендовал начать с Си, можно почитать Кернигана и Ричи. Да в инете инфы уже завались приличной.
С Java начинать можно, но потом все равно придется вернуться к Си, скорее всего, чтобы посмотреть, что такое прямой доступ к памяти, как она очищается, какие там проблемы из-за этого, как их решили в других языках, например, в той же Java.