вообще-то поверхность платы используется для теплоотвода для множества мелких силовых ключей на ней и стабилизаторов. поэтому вырезка щита на плату хоть и заметно дороже и сложнее, но все же лучше в плане именно охлаждения. опять же степень нагрева материнки сильно зависит от энергоэффективности установленных чипов и охлаждения - есди температуры процессора и моста не превышают 40 градусов под нагрузкой то я думаю можно красить - сильного нагрева не будет

По мне так плохая идея красить, ничего путного из этого не выйдет, толи мамку испортишь, то ли получится топорно...