Почему-то процес system постоянно загружает систему на 99%. Что это может быть? после ребута через некоторое время опять он на 99

Если это именно System грузит систему- у тебя скорее всего завелся какой-то вирус или прога какая-то запущена постоянно.
Если все же, его полное имя System Idle Process- он не загружает систему, в чем можно убедиться если глянуть на график загрузки CPU, а наоборот показывает ее "простой".

переустановка с обновлением системы до последних апдейтов