С: в NTFS, D: в FAT32, на С: стоит ХР, на С: создаю папку dos, кидаю туда файлы необходимые для загрузки этой ОС и правлю boot.ini :

В результате меню при загрузке появляется, но при выборе доса комп перезагружается, а если вместо partition(2) набрать partition(0) , то пишет, что невозможно загрузить Windows (?). Можно ли это исправить?

и все?..
А кто будет делать диск системным?

Лучший способ (имхо):
1.Форматишь винт
2.Делаешь C системным (грузишься с системной дискетки, запускаешь sys c:)
3.Устанавливаешь ХР на D, С оставляешь FAT32, D - NTFS

вуаля

LS
Во-первых, чтобы DOS грузился, диск надо сделать системным.
Берешь загрузочную дискету нужной версии (6.22, 7.0), грузишься с нее. Проверяешь именование дисков. Потом делаешь
sys X: A:, где Х - тот диск, который у тебя должен быть для DOS, а А: - это путь к дискетке.

Во-вторых, чтобы в boot.ini дать опцию загрузки DOS, не нужно писать полный физический адрес диска. А те же самые Х:.
Например,
D:\="MS DOS".

Ну а если нет желания гемороиться, все где-нибудь сохраняешь, ставишь на С: 98-й, а на D: - ХР. И все само станет так, как нужно.