Проблема в том что при выключении компа Виста его не до конца выключает. Входит в состояние похожее на сон. Вот только из этого сна его может вывести либо ресет либо подержать кнопку включения несколько секунд а затем включить обычным способом.
С ХР таких загонов не было.

у меня была такая же хрень, решал просто выдергивнием компа из розетки, виста все свое завершает, только вот сигнал именно на отрубление компа не подает, хз почему, после переустановки проблема решилась

1) Как именно выключаете комп ? Через кнопку или через меню "выключить" ?

2) В настроки плана энергосбережения лазали, в advanced parameters ?

По-моему в Висте если нажать на стандартную красную кнопку с изображением выключения( как мы к этому привыкли в XP), то комп перейдет в режим сна. Чтобы его выключить нужно нажать на кнопку со стрелкой, которая расположена справа от красной кнопки, и выбрать там в выпадающем меню "Завершение работы"

или поменять настройки

то же с кнопкой на корпусе.