Как в Adobe Reader добавить комментарии, примечание к pdf файлу. Выбираю Tools-> Customize Toolbars ставлю, галочки Comment and Markup Toolbar, сохраняю. Новое меню в панели не появляются и галочки Comment and Markup Toolbar убираются. Может проблема с правами, но я сам создаю документ в Word и конвертирую в pdf.

Так Reader'ом вообще нельзя вносить никаких изменения в pdf'ы. Он только для просмотра.

Воспользуйся альтернативными prf просмоторщиками, например Foxit PDF Reader или PDF-XChange Viewer